293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4322 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1797 aa  3698    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.42 
 
 
1773 aa  1350    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.98 
 
 
1783 aa  1276    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  27.05 
 
 
937 aa  209  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  27.85 
 
 
903 aa  201  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.17 
 
 
2552 aa  148  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  31.1 
 
 
1223 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.82 
 
 
835 aa  133  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  24.89 
 
 
1351 aa  123  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.54 
 
 
1328 aa  121  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  26.98 
 
 
1748 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.5 
 
 
1726 aa  118  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.82 
 
 
1231 aa  117  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.35 
 
 
1343 aa  115  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  30.81 
 
 
1204 aa  112  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  28.35 
 
 
697 aa  109  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.63 
 
 
1234 aa  108  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  27.39 
 
 
1613 aa  106  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  26.26 
 
 
925 aa  103  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.44 
 
 
1016 aa  97.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  23.09 
 
 
2030 aa  90.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  28.63 
 
 
1215 aa  85.5  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  29.41 
 
 
501 aa  85.5  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.61 
 
 
2171 aa  85.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  25.71 
 
 
1296 aa  84.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  30.11 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.29 
 
 
1253 aa  82.8  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  33.7 
 
 
700 aa  82.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  29.41 
 
 
688 aa  82.4  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  32.16 
 
 
1003 aa  81.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.85 
 
 
2182 aa  80.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  31.82 
 
 
1029 aa  80.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.16 
 
 
509 aa  81.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  30.88 
 
 
491 aa  80.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  28.8 
 
 
495 aa  79.3  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  30.57 
 
 
371 aa  79  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.75 
 
 
1174 aa  78.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.43 
 
 
866 aa  78.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  27.36 
 
 
324 aa  78.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.74 
 
 
1239 aa  77.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.3 
 
 
1008 aa  77  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  30.3 
 
 
1294 aa  77  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  29.65 
 
 
1437 aa  77  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  29.41 
 
 
362 aa  76.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  29.51 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  31.66 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  27.72 
 
 
757 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.98 
 
 
986 aa  75.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1792  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.84 
 
 
686 aa  74.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0554398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  29.85 
 
 
657 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.94 
 
 
1106 aa  74.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  31.91 
 
 
755 aa  73.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.84 
 
 
1261 aa  73.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  31.23 
 
 
644 aa  72.8  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.08 
 
 
1262 aa  72.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.56 
 
 
678 aa  72.4  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.08 
 
 
1262 aa  72.4  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  33.99 
 
 
1575 aa  72  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  33.88 
 
 
571 aa  72  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 
1060 aa  71.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.81 
 
 
665 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  28.35 
 
 
736 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  30.37 
 
 
646 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  32.53 
 
 
541 aa  71.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  27.69 
 
 
1668 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  25.18 
 
 
1318 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  32.43 
 
 
394 aa  70.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0026  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
823 aa  70.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  29.41 
 
 
634 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  29.53 
 
 
533 aa  70.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  24.68 
 
 
1055 aa  70.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5651  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.6 
 
 
628 aa  69.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  31.16 
 
 
996 aa  69.3  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  27.59 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.31 
 
 
1172 aa  68.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.33 
 
 
999 aa  68.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2971  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 
534 aa  68.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1767  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
773 aa  67.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.126212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.08 
 
 
997 aa  67.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.08 
 
 
1501 aa  67.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  33.57 
 
 
297 aa  67.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  32.97 
 
 
933 aa  67  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  27.51 
 
 
340 aa  66.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  25.16 
 
 
1263 aa  65.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
1015 aa  65.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  28.89 
 
 
558 aa  65.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.09 
 
 
576 aa  65.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1027  hypothetical protein  29.76 
 
 
1525 aa  65.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.275206  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  30.43 
 
 
336 aa  65.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.99 
 
 
1285 aa  64.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.05 
 
 
1054 aa  64.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4109  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.79 
 
 
520 aa  64.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.941558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  31.58 
 
 
408 aa  64.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0927  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.62 
 
 
795 aa  64.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  35.25 
 
 
1433 aa  64.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.35 
 
 
398 aa  63.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1569  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.61 
 
 
806 aa  63.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.3 
 
 
479 aa  63.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35 
 
 
570 aa  63.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1626  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.23 
 
 
432 aa  63.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000205027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>