131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5679 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  100 
 
 		 511 aa  1042    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  26.65 
 
 		 2713 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  30 
 
 		 938 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  24.31 
 
 		 2402 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  26.69 
 
 		 787 aa  63.9  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1064 aa  60.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  31.01 
 
 		 820 aa  57  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  34.07 
 
 		 938 aa  57  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1329 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  26.97 
 
 		 4071 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  26.2 
 
 		 575 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  26.24 
 
 		 1311 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.52 
 
 		 991 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1682 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  45.1 
 
 		 596 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  34.4 
 
 		 685 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.21 
 
 		 786 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  32.47 
 
 		 3197 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.36 
 
 		 2272 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  27.93 
 
 		 978 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0723  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.88 
 
 		 835 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3411  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.88 
 
 		 835 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.26 
 
 		 1371 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.81 
 
 		 945 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  45.16 
 
 		 2176 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  47.06 
 
 		 560 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  29.2 
 
 		 865 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.16 
 
 		 752 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.07 
 
 		 5298 aa  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  50.88 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  24.34 
 
 		 1266 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  31.82 
 
 		 951 aa  49.7  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  29.17 
 
 		 1463 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  31.82 
 
 		 823 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  26.55 
 
 		 735 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  25.76 
 
 		 2833 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.42 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  26.84 
 
 		 1095 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  40.91 
 
 		 1361 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  29.2 
 
 		 2554 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  30.71 
 
 		 1389 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.01 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  27.09 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  26.11 
 
 		 1292 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  23.71 
 
 		 1657 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  31.17 
 
 		 3197 aa  48.5  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  29.41 
 
 		 1667 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 		 3295 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  25.35 
 
 		 561 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  35.29 
 
 		 1565 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  46.15 
 
 		 852 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  38.16 
 
 		 815 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  25.32 
 
 		 1230 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  32.21 
 
 		 935 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1830 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  43.64 
 
 		 1194 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.29 
 
 		 734 aa  47.8  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  34.04 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  28.33 
 
 		 845 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  26.87 
 
 		 823 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  30.87 
 
 		 1120 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.25 
 
 		 2122 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.19 
 
 		 2000 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  32.88 
 
 		 341 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1620 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.29 
 
 		 836 aa  47  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  28.83 
 
 		 1151 aa  47  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  25 
 
 		 552 aa  47  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  25.63 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  35.56 
 
 		 317 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  34.04 
 
 		 859 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  45.83 
 
 		 1528 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  36.59 
 
 		 777 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  29.03 
 
 		 530 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01501  putative secreted serine protease, subtilisin family, possibly excreted  36.84 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  28.23 
 
 		 1356 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.63 
 
 		 1602 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0867  serine protease  41.89 
 
 		 818 aa  45.8  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  39.34 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  40.58 
 
 		 1300 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0361  alpha amylase catalytic region  24.84 
 
 		 958 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  25.62 
 
 		 929 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  29.71 
 
 		 1345 aa  45.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  22.16 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  22.57 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  29.25 
 
 		 778 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.39 
 
 		 1158 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  29.77 
 
 		 778 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4627  hypothetical protein  27.38 
 
 		 608 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.254365  normal  0.63618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  32.33 
 
 		 951 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  29.25 
 
 		 778 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.7 
 
 		 699 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  29.25 
 
 		 778 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  33.67 
 
 		 184 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1057 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  46.15 
 
 		 792 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 835 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  32.53 
 
 		 1104 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  32.53 
 
 		 1104 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  29.61 
 
 		 1987 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>