16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3105 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1588    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  29.76 
 
 		 1452 aa  81.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  30.55 
 
 		 1223 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  26.28 
 
 		 511 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  32.43 
 
 		 2416 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  34.62 
 
 		 1337 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  32.53 
 
 		 1348 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1184 aa  48.5  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  33.33 
 
 		 1302 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1070 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  27.21 
 
 		 2262 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0411  hemagglutinin, putative  27.43 
 
 		 925 aa  45.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1329 aa  44.7  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  32.84 
 
 		 843 aa  44.3  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5007  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 		 554 aa  44.3  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  36.36 
 
 		 1063 aa  44.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>