More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6914 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1230 aa  2523    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  32.84 
 
 		 1152 aa  527  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  32.69 
 
 		 1111 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  29.81 
 
 		 2554 aa  317  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.7 
 
 		 1862 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  28.23 
 
 		 3295 aa  224  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  30.15 
 
 		 801 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  27.49 
 
 		 812 aa  181  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  25.65 
 
 		 1531 aa  173  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  32.41 
 
 		 1987 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.33 
 
 		 752 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.8 
 
 		 815 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  32.42 
 
 		 859 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.52 
 
 		 1094 aa  131  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1667 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  29.91 
 
 		 735 aa  129  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  30 
 
 		 958 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  30.22 
 
 		 963 aa  128  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  30.81 
 
 		 528 aa  126  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.01 
 
 		 669 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.03 
 
 		 2036 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  33.03 
 
 		 679 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  31.53 
 
 		 1842 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.84 
 
 		 675 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.52 
 
 		 1300 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  29.81 
 
 		 575 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  31.48 
 
 		 713 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.2 
 
 		 685 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  28.54 
 
 		 1389 aa  119  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  26.44 
 
 		 1532 aa  118  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  31.5 
 
 		 1361 aa  118  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.57 
 
 		 2122 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  30.65 
 
 		 1882 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1682 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.98 
 
 		 1371 aa  115  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  28.99 
 
 		 978 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  26.2 
 
 		 650 aa  115  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  31.38 
 
 		 658 aa  114  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  29.01 
 
 		 1241 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.68 
 
 		 561 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  30.73 
 
 		 1356 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  28.31 
 
 		 1120 aa  112  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.72 
 
 		 1606 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  28.11 
 
 		 941 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.05 
 
 		 930 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  34.15 
 
 		 551 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.61 
 
 		 2272 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.84 
 
 		 1620 aa  109  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  33.07 
 
 		 615 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  28.61 
 
 		 761 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.41 
 
 		 1969 aa  108  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.95 
 
 		 2000 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.99 
 
 		 861 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  26.61 
 
 		 530 aa  107  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  33.82 
 
 		 791 aa  105  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  34.74 
 
 		 581 aa  105  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  31.04 
 
 		 1387 aa  105  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  30.58 
 
 		 652 aa  104  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.85 
 
 		 547 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  28.07 
 
 		 1814 aa  102  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  30.9 
 
 		 865 aa  102  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  30.37 
 
 		 460 aa  102  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.02 
 
 		 1667 aa  101  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  26.14 
 
 		 2980 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  46.51 
 
 		 3542 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30.8 
 
 		 1236 aa  99.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.33 
 
 		 2176 aa  99  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.93 
 
 		 1222 aa  98.2  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  29.29 
 
 		 603 aa  97.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  35.96 
 
 		 910 aa  97.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  28.64 
 
 		 890 aa  95.1  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  29.21 
 
 		 1528 aa  95.1  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  28.13 
 
 		 869 aa  94.7  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  26.22 
 
 		 885 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  28.74 
 
 		 642 aa  94.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  36 
 
 		 644 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.59 
 
 		 930 aa  94.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  31.02 
 
 		 1732 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  33.18 
 
 		 840 aa  92.8  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  28.17 
 
 		 777 aa  92.4  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  32.71 
 
 		 845 aa  91.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.02 
 
 		 823 aa  91.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  27.83 
 
 		 677 aa  91.3  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  39.72 
 
 		 940 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.86 
 
 		 1602 aa  91.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  34.32 
 
 		 816 aa  90.9  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.84 
 
 		 734 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  28 
 
 		 1162 aa  90.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1313 aa  90.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  31.16 
 
 		 719 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  34.65 
 
 		 1095 aa  90.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  35.29 
 
 		 184 aa  89.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  25.78 
 
 		 2972 aa  89.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  30.12 
 
 		 838 aa  89.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.17 
 
 		 786 aa  89  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.67 
 
 		 1466 aa  88.2  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  26.79 
 
 		 929 aa  88.2  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1282 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  27.25 
 
 		 870 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  30.08 
 
 		 938 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>