51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1823 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  100 
 
 		 761 aa  1521    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.01 
 
 		 2554 aa  180  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  31.01 
 
 		 801 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  31.6 
 
 		 1531 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  31.53 
 
 		 603 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  31.84 
 
 		 1862 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  31.71 
 
 		 812 aa  162  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 3295 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  30.53 
 
 		 1152 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  29.13 
 
 		 1230 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  30.43 
 
 		 1532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1111 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  33.59 
 
 		 421 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  24.3 
 
 		 940 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.98 
 
 		 1848 aa  77.4  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  25.62 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  27.73 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  26.79 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  40.5 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1976 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  27.93 
 
 		 316 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  35.37 
 
 		 501 aa  61.2  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  29.15 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  26.27 
 
 		 1131 aa  60.8  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  24.85 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  27.21 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  23.75 
 
 		 840 aa  56.2  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  24.6 
 
 		 2068 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  23.81 
 
 		 471 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  35.11 
 
 		 631 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.53 
 
 		 306 aa  54.7  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  27.39 
 
 		 430 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.58 
 
 		 688 aa  53.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  36.44 
 
 		 2286 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  25.38 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.81 
 
 		 798 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  22.53 
 
 		 938 aa  52.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  26.23 
 
 		 296 aa  51.2  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  27.47 
 
 		 696 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  21.81 
 
 		 481 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  22.37 
 
 		 436 aa  48.9  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  25.71 
 
 		 553 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  22.58 
 
 		 485 aa  48.5  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.57 
 
 		 1272 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  29.56 
 
 		 789 aa  48.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.29 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  24.38 
 
 		 391 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  25.33 
 
 		 456 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  27.95 
 
 		 813 aa  45.8  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.47 
 
 		 648 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  22.91 
 
 		 463 aa  44.3  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>