36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4747 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  100 
 
 
801 aa  1610    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  36.37 
 
 
812 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.42 
 
 
2554 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  32.55 
 
 
3295 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  33.28 
 
 
1531 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  32.13 
 
 
1862 aa  241  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  30.15 
 
 
1230 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.9 
 
 
1152 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.23 
 
 
1111 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  29.17 
 
 
1532 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  31.99 
 
 
603 aa  181  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  31.01 
 
 
761 aa  174  7.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  29.61 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  49.47 
 
 
208 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  28.4 
 
 
472 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  25.33 
 
 
940 aa  78.2  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.51 
 
 
501 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  26.68 
 
 
696 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2034  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  60.8  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  27.34 
 
 
439 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3327  metallophosphoesterase  40.74 
 
 
492 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  27.08 
 
 
485 aa  55.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4097  phosphoesterase  42.68 
 
 
396 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  25.13 
 
 
480 aa  54.7  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  26.71 
 
 
460 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.67 
 
 
430 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.04 
 
 
2068 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  25.63 
 
 
938 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  33.13 
 
 
553 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.43 
 
 
378 aa  48.5  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  26.25 
 
 
950 aa  48.5  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3522  hypothetical protein  38.03 
 
 
334 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  30.3 
 
 
513 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  29.5 
 
 
688 aa  47.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4181  phospholipase C  32.47 
 
 
522 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.508071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.58 
 
 
1848 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>