272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2603 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  100 
 
 		 1466 aa  3006    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.71 
 
 		 1606 aa  293  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  26.07 
 
 		 1620 aa  266  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.33 
 
 		 1602 aa  246  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1667 aa  186  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  25.82 
 
 		 1371 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.66 
 
 		 1094 aa  161  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  26.4 
 
 		 1389 aa  157  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  24.35 
 
 		 1528 aa  149  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.57 
 
 		 1862 aa  145  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  24.95 
 
 		 1361 aa  141  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  26.55 
 
 		 1667 aa  139  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.38 
 
 		 886 aa  132  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  28.18 
 
 		 650 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  26.23 
 
 		 941 aa  126  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  30.7 
 
 		 642 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.57 
 
 		 2272 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  25.16 
 
 		 1814 aa  123  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  24.61 
 
 		 2176 aa  122  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  23.7 
 
 		 1162 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.35 
 
 		 1842 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  30.63 
 
 		 890 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  24.5 
 
 		 1011 aa  112  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  31.99 
 
 		 2980 aa  111  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.51 
 
 		 752 aa  111  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1682 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.9 
 
 		 963 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  25.62 
 
 		 1387 aa  109  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1287 aa  109  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.1 
 
 		 561 aa  108  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  31.31 
 
 		 859 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  29.73 
 
 		 575 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.91 
 
 		 930 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  36.36 
 
 		 1241 aa  105  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.52 
 
 		 885 aa  105  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  36.07 
 
 		 978 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  29.86 
 
 		 2554 aa  103  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  36.07 
 
 		 2036 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  36.68 
 
 		 547 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.33 
 
 		 808 aa  101  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  33.61 
 
 		 551 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  34.8 
 
 		 685 aa  100  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1282 aa  99.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  27.6 
 
 		 528 aa  99.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  33.58 
 
 		 713 aa  99  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  33.21 
 
 		 1300 aa  99  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  24.48 
 
 		 2972 aa  98.6  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  34.88 
 
 		 581 aa  98.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  25.47 
 
 		 662 aa  98.6  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.1 
 
 		 1969 aa  98.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  30.41 
 
 		 2122 aa  97.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  35.89 
 
 		 791 aa  97.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  33.73 
 
 		 1356 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  27.29 
 
 		 958 aa  97.4  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  27.44 
 
 		 530 aa  96.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.09 
 
 		 735 aa  96.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  26.05 
 
 		 1783 aa  96.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  35.12 
 
 		 1882 aa  96.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  34.84 
 
 		 1120 aa  96.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  32.55 
 
 		 615 aa  95.9  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  23.82 
 
 		 865 aa  95.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  35.43 
 
 		 658 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  33.73 
 
 		 679 aa  94.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  34.51 
 
 		 669 aa  94.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  26.57 
 
 		 1987 aa  94  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  32.58 
 
 		 869 aa  94.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.95 
 
 		 675 aa  93.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  34.18 
 
 		 2000 aa  92.8  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1228 aa  92.8  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.27 
 
 		 1236 aa  90.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  25.47 
 
 		 838 aa  90.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.21 
 
 		 822 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1488 aa  89.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  34.45 
 
 		 443 aa  89.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  32.81 
 
 		 3295 aa  88.6  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  30 
 
 		 460 aa  87.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  25.28 
 
 		 2411 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  25.82 
 
 		 734 aa  87.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  25.28 
 
 		 2367 aa  87  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  25.5 
 
 		 2421 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  25.5 
 
 		 2454 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.67 
 
 		 1230 aa  85.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.76 
 
 		 930 aa  85.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  29.51 
 
 		 929 aa  85.5  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  25.5 
 
 		 2807 aa  85.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  26.4 
 
 		 861 aa  85.1  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  44.44 
 
 		 652 aa  85.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.24 
 
 		 910 aa  84  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  24.36 
 
 		 952 aa  83.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.03 
 
 		 3227 aa  82.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  29.01 
 
 		 794 aa  81.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.33 
 
 		 1565 aa  81.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  25.99 
 
 		 1057 aa  81.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  41.38 
 
 		 3542 aa  80.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.2 
 
 		 1732 aa  79.7  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  30.33 
 
 		 823 aa  79  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  24.94 
 
 		 938 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.8 
 
 		 627 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  33.06 
 
 		 971 aa  77.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  30.13 
 
 		 719 aa  77.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>