60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4990 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 1532 aa  3044    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  33.23 
 
 		 812 aa  213  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  31.77 
 
 		 2554 aa  207  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  31.39 
 
 		 1531 aa  194  8e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  29.46 
 
 		 801 aa  192  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  32.61 
 
 		 1862 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  31.51 
 
 		 3295 aa  179  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1111 aa  126  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.84 
 
 		 1230 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  28.1 
 
 		 1152 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  30.18 
 
 		 761 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  34.67 
 
 		 603 aa  120  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0772  fibronectin type III domain-containing protein  44.83 
 
 		 497 aa  97.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  29.93 
 
 		 2042 aa  95.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.04 
 
 		 1284 aa  94.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  42.54 
 
 		 2042 aa  88.6  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  40.43 
 
 		 1394 aa  88.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  34.9 
 
 		 2192 aa  84  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  37.5 
 
 		 1225 aa  83.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.44 
 
 		 940 aa  70.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  30.2 
 
 		 2503 aa  69.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  29.08 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  29.8 
 
 		 2476 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  29.57 
 
 		 708 aa  68.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  35.16 
 
 		 3209 aa  68.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1504 aa  67.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.84 
 
 		 3699 aa  67.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  28.29 
 
 		 2522 aa  67  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.17 
 
 		 3699 aa  65.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4277  Ig domain-containing protein  40 
 
 		 690 aa  65.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.39 
 
 		 501 aa  64.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.07 
 
 		 378 aa  63.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  32.56 
 
 		 208 aa  63.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.46 
 
 		 1848 aa  60.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  32.35 
 
 		 3544 aa  59.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1969 aa  58.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  26.78 
 
 		 840 aa  58.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3414  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1000 aa  56.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.789189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 475 aa  56.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  24.69 
 
 		 472 aa  55.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.97 
 
 		 430 aa  55.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25.73 
 
 		 3507 aa  54.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  29.64 
 
 		 2636 aa  53.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1588 aa  53.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1321 aa  53.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  37.23 
 
 		 746 aa  52.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  26.55 
 
 		 463 aa  52.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  24.88 
 
 		 491 aa  51.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.89 
 
 		 2068 aa  50.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  25.96 
 
 		 258 aa  50.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  38.55 
 
 		 287 aa  50.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  25.5 
 
 		 404 aa  49.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  35 
 
 		 2262 aa  49.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3285  Outer membrane autotransporter barrel  41.32 
 
 		 1895 aa  48.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.761058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  25.95 
 
 		 439 aa  48.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.78 
 
 		 4433 aa  48.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1585 aa  47.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  26.91 
 
 		 391 aa  46.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  25.49 
 
 		 917 aa  46.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.5 
 
 		 471 aa  45.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>