78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1915 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  100 
 
 		 501 aa  993    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  26.77 
 
 		 696 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.36 
 
 		 940 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  30.68 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  26.36 
 
 		 938 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  25.84 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  23.02 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  27.51 
 
 		 401 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  25.81 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.55 
 
 		 1848 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  26.34 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  25.36 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  24.79 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  26.23 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  25.24 
 
 		 626 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.49 
 
 		 688 aa  90.9  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  29.81 
 
 		 603 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  26.12 
 
 		 404 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.49 
 
 		 378 aa  87  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25.52 
 
 		 870 aa  85.5  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1976 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  26.75 
 
 		 2286 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  27.12 
 
 		 2554 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  25 
 
 		 840 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  26.27 
 
 		 553 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  27.24 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  25.68 
 
 		 1131 aa  80.5  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  27.49 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1329 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  23.82 
 
 		 3295 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  23.82 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1969 aa  74.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  26.67 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  26.35 
 
 		 708 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.76 
 
 		 1272 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  23.19 
 
 		 629 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  22.81 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  25.07 
 
 		 553 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  27.47 
 
 		 1531 aa  70.1  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  22.2 
 
 		 2068 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.19 
 
 		 3507 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  23.37 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  22.36 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  22.76 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  25.51 
 
 		 801 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  25.84 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  23.42 
 
 		 4433 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0420  hypothetical protein  23.62 
 
 		 582 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  27.73 
 
 		 1532 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  35.37 
 
 		 761 aa  61.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.63 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  24.51 
 
 		 714 aa  61.2  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  24.41 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  25.86 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  22.98 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  24.69 
 
 		 917 aa  58.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  24.73 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  25.38 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  28.14 
 
 		 950 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  29.01 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.71 
 
 		 1862 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  25.34 
 
 		 938 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 603 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00492503  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.63 
 
 		 769 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.39 
 
 		 2122 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  43.48 
 
 		 208 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.41 
 
 		 1617 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.7 
 
 		 434 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1287 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3235  hypothetical protein  30.13 
 
 		 611 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  24.69 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  23.4 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  25.58 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  26.92 
 
 		 200 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1449  hypothetical protein  21.83 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  26.59 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3322  hypothetical protein  28.74 
 
 		 603 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  22.5 
 
 		 864 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>