13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0420 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0420  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1174    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  28.47 
 
 
940 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  30 
 
 
938 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  22.98 
 
 
1329 aa  65.1  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  29.27 
 
 
1969 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  23.62 
 
 
501 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.84 
 
 
430 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  24.59 
 
 
472 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  27.82 
 
 
553 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  23.68 
 
 
626 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  24.77 
 
 
917 aa  46.6  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  27.97 
 
 
1976 aa  43.9  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  22.45 
 
 
400 aa  43.9  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>