73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2299 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  100 
 
 		 485 aa  966    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  46.6 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  43.99 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  43.68 
 
 		 471 aa  279  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  42.86 
 
 		 463 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  37.95 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  34.16 
 
 		 480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  36.97 
 
 		 513 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  35.14 
 
 		 2068 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  33.5 
 
 		 3507 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  33.09 
 
 		 4433 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  30.57 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.3 
 
 		 1272 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  31.73 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.94 
 
 		 472 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  30.11 
 
 		 491 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  29.31 
 
 		 400 aa  90.9  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  34.74 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  28.72 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  26.46 
 
 		 2286 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  29.23 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  26.91 
 
 		 938 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.56 
 
 		 930 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.84 
 
 		 676 aa  73.9  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  29.27 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.63 
 
 		 940 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  24.92 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  24.56 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  22.76 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  27.66 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  25.97 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.26 
 
 		 1848 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  29.77 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  33.1 
 
 		 627 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  35.87 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  29.87 
 
 		 831 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  27.97 
 
 		 801 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  28.08 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  25.51 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  30.2 
 
 		 668 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.28 
 
 		 579 aa  57  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.64 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.66 
 
 		 346 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  30.34 
 
 		 664 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  28.68 
 
 		 2554 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  20.52 
 
 		 870 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  32.53 
 
 		 917 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  29.09 
 
 		 812 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  24.73 
 
 		 408 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  31.46 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.74 
 
 		 930 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.71 
 
 		 522 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  25.82 
 
 		 708 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  26.34 
 
 		 963 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.94 
 
 		 3295 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.43 
 
 		 2807 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  29.57 
 
 		 353 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  26.57 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  33.76 
 
 		 1531 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  24.7 
 
 		 429 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.93 
 
 		 709 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  26.8 
 
 		 603 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  28.4 
 
 		 840 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1750 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.88 
 
 		 343 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  25 
 
 		 588 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  24.67 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.31 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1933 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.92 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  24.5 
 
 		 761 aa  44.3  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1163 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1068 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>