84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1289 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  100 
 
 
403 aa  786    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  87.59 
 
 
400 aa  644    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  86.1 
 
 
491 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  77.53 
 
 
401 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  43.61 
 
 
629 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  41.05 
 
 
391 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  42.63 
 
 
404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  39.53 
 
 
378 aa  252  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  43.63 
 
 
840 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  40.42 
 
 
626 aa  251  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  37.92 
 
 
417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  50.38 
 
 
258 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  32.43 
 
 
870 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  33.33 
 
 
553 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  33.11 
 
 
559 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  36.45 
 
 
408 aa  173  5e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  32.99 
 
 
1131 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  30.49 
 
 
410 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  30.84 
 
 
528 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  34.34 
 
 
940 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  30.42 
 
 
481 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  48.77 
 
 
200 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  31.06 
 
 
382 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  31.88 
 
 
432 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  28.85 
 
 
538 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  31.39 
 
 
502 aa  127  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  26.57 
 
 
405 aa  125  9e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  30.73 
 
 
938 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.83 
 
 
1287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  29.54 
 
 
463 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  25.36 
 
 
501 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  27.03 
 
 
477 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  28.08 
 
 
2286 aa  96.3  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  25.62 
 
 
575 aa  94.7  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  28.57 
 
 
436 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.44 
 
 
456 aa  91.3  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.98 
 
 
2068 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  23.5 
 
 
708 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  27.4 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  28.65 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.68 
 
 
769 aa  87  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  24.44 
 
 
472 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  27.13 
 
 
471 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  27.27 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  26.85 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.84 
 
 
4433 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  23.4 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  27.27 
 
 
714 aa  77  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.13 
 
 
1272 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0144  hypothetical protein  24.93 
 
 
368 aa  76.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  26.73 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  26.96 
 
 
3507 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  31.87 
 
 
938 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 
1557 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  25.7 
 
 
917 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  23.84 
 
 
696 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  25.7 
 
 
889 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.38 
 
 
1862 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  25.71 
 
 
858 aa  67  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  31.21 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  21.18 
 
 
688 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  25.79 
 
 
480 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  23.29 
 
 
669 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  22.93 
 
 
901 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.5 
 
 
1848 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  24.35 
 
 
2807 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  25.82 
 
 
513 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  26.46 
 
 
1933 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  26.59 
 
 
2198 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  25.35 
 
 
487 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0939  hypothetical protein  20.78 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0324617  normal  0.305646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.87 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  23.86 
 
 
8871 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1755  hypothetical protein  21.28 
 
 
529 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1449  hypothetical protein  23.62 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  23.62 
 
 
864 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  21.89 
 
 
2864 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.47 
 
 
1454 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  21.68 
 
 
3563 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1367  hypothetical protein  23.4 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0144169  hitchhiker  0.000000182251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4030  hypothetical protein  27.63 
 
 
298 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  33.33 
 
 
553 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1177  hypothetical protein  23.83 
 
 
325 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00264857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  26.74 
 
 
1027 aa  43.1  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>