91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0568 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  100 
 
 		 553 aa  1133    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.84 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  30.28 
 
 		 430 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.89 
 
 		 1848 aa  91.3  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.07 
 
 		 940 aa  83.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.54 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 688 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  28.3 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.28 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  28.97 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  25.86 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  23.73 
 
 		 1531 aa  67.8  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1976 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  27.42 
 
 		 2554 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  34.35 
 
 		 938 aa  63.9  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  26.63 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.77 
 
 		 861 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  27.34 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  25.97 
 
 		 3295 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  23.79 
 
 		 1131 aa  59.7  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  43.53 
 
 		 930 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1969 aa  58.2  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  24.09 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  27.96 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  31.61 
 
 		 917 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.8 
 
 		 1094 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.32 
 
 		 1862 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1682 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  28.33 
 
 		 812 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  35.96 
 
 		 824 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0420  hypothetical protein  27.82 
 
 		 582 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 		 1272 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  43.21 
 
 		 1300 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  25.81 
 
 		 4433 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  33.66 
 
 		 1565 aa  51.2  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  32.95 
 
 		 2286 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  26.57 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1329 aa  50.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  31.45 
 
 		 208 aa  50.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1667 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.98 
 
 		 1842 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  43.21 
 
 		 2036 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  41.98 
 
 		 1882 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  27.93 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  33.13 
 
 		 801 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  36.14 
 
 		 978 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  30.94 
 
 		 2068 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  33.6 
 
 		 1969 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.92 
 
 		 1606 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  33.61 
 
 		 391 aa  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.11 
 
 		 1387 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  25.39 
 
 		 761 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  27.87 
 
 		 840 aa  47.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.47 
 
 		 942 aa  47.4  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  38.27 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  26.67 
 
 		 2122 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  38 
 
 		 791 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37.11 
 
 		 1356 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  31.62 
 
 		 677 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  27.96 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  37.08 
 
 		 1441 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  31.25 
 
 		 780 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  30.59 
 
 		 940 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  29.82 
 
 		 1814 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  39.47 
 
 		 669 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  37.33 
 
 		 963 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  34.04 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  34.41 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  24.22 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  40.74 
 
 		 1120 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.47 
 
 		 675 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.47 
 
 		 777 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  34.58 
 
 		 658 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  43.14 
 
 		 1057 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  37.5 
 
 		 859 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  33.33 
 
 		 823 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  33.77 
 
 		 560 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  39.47 
 
 		 685 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  28.44 
 
 		 708 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  30.21 
 
 		 1916 aa  44.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  23.96 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1259  PKD domain containing protein  32.63 
 
 		 445 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.501377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 491 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  34.88 
 
 		 581 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  36.05 
 
 		 1732 aa  44.3  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.83 
 
 		 623 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  40.96 
 
 		 1532 aa  43.9  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  28.71 
 
 		 2176 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  30.83 
 
 		 958 aa  43.5  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1830 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>