21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2033 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  41.6 
 
 		 2554 aa  89  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  44.44 
 
 		 603 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  37.5 
 
 		 1862 aa  85.9  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  49.47 
 
 		 801 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  41.98 
 
 		 1531 aa  79.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  40.16 
 
 		 812 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 3295 aa  75.1  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  40.5 
 
 		 761 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  32.56 
 
 		 1532 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.19 
 
 		 1848 aa  51.6  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  36.52 
 
 		 1230 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  31.45 
 
 		 553 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  55.56 
 
 		 430 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  43.48 
 
 		 501 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  31.03 
 
 		 1152 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.86 
 
 		 1272 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  30.43 
 
 		 940 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.59 
 
 		 472 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1111 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1976 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>