195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3715 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  100 
 
 		 1111 aa  2273    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  38.26 
 
 		 1152 aa  628  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  32.69 
 
 		 1230 aa  496  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  24.06 
 
 		 2554 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  27.89 
 
 		 801 aa  184  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  24.05 
 
 		 1531 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  23.46 
 
 		 1862 aa  149  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  24.56 
 
 		 3295 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  25.88 
 
 		 812 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  25.52 
 
 		 1532 aa  111  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  26.34 
 
 		 761 aa  102  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  28.18 
 
 		 603 aa  99  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  25.93 
 
 		 1987 aa  82  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1980 aa  73.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  46.97 
 
 		 4896 aa  73.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  26.76 
 
 		 1466 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  27.67 
 
 		 1094 aa  71.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.23 
 
 		 2272 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  28.96 
 
 		 1969 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  30.45 
 
 		 581 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  33.86 
 
 		 2377 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1682 aa  69.3  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  44.44 
 
 		 3927 aa  68.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  27.52 
 
 		 1300 aa  68.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.11 
 
 		 713 aa  68.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.34 
 
 		 752 aa  68.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  28.38 
 
 		 1620 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.39 
 
 		 679 aa  67.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.55 
 
 		 2122 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  28.46 
 
 		 551 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  41.11 
 
 		 3793 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  28.52 
 
 		 421 aa  67.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  27.05 
 
 		 958 aa  67  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  28.05 
 
 		 1120 aa  66.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  29.55 
 
 		 2000 aa  66.2  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  30.05 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  26.29 
 
 		 650 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 3471 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  27.76 
 
 		 675 aa  65.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  38.1 
 
 		 1483 aa  65.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  28.98 
 
 		 669 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.15 
 
 		 547 aa  64.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  27.02 
 
 		 575 aa  64.3  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  27.31 
 
 		 735 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  26.67 
 
 		 685 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  25.84 
 
 		 886 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  28.74 
 
 		 978 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  36.59 
 
 		 2402 aa  63.9  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  25.61 
 
 		 859 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  23.75 
 
 		 1371 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  24.81 
 
 		 861 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1067 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  26.58 
 
 		 938 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.16 
 
 		 2036 aa  62.4  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  28.57 
 
 		 581 aa  61.6  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  26.32 
 
 		 1241 aa  60.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  29.1 
 
 		 963 aa  60.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  25.45 
 
 		 1288 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  39.29 
 
 		 599 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  29.07 
 
 		 930 aa  61.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  27.64 
 
 		 1842 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  24.89 
 
 		 869 aa  60.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  28.57 
 
 		 3227 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  24.48 
 
 		 657 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.53 
 
 		 1602 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  27.2 
 
 		 1667 aa  60.1  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.81 
 
 		 658 aa  59.3  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  28.51 
 
 		 1882 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  25.4 
 
 		 1528 aa  59.7  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1193 aa  59.3  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  27.97 
 
 		 1356 aa  59.3  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  36.19 
 
 		 2588 aa  59.3  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  24.36 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1287 aa  58.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  25.75 
 
 		 791 aa  57.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1059 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  43.86 
 
 		 637 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  25 
 
 		 662 aa  57.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  23.75 
 
 		 636 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  25.88 
 
 		 1361 aa  56.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1667 aa  55.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  29.17 
 
 		 742 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  27.03 
 
 		 941 aa  55.1  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.29 
 
 		 1547 aa  54.7  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  39.36 
 
 		 400 aa  54.3  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  34.48 
 
 		 2270 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  24.65 
 
 		 929 aa  53.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  23.53 
 
 		 1389 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  25.86 
 
 		 3197 aa  53.5  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  41.43 
 
 		 751 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  26.54 
 
 		 2980 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  25.17 
 
 		 1732 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  32.23 
 
 		 951 aa  52.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  25.97 
 
 		 561 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  26.32 
 
 		 1011 aa  53.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.42 
 
 		 1814 aa  53.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.8 
 
 		 1387 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  27.92 
 
 		 689 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  38.3 
 
 		 2487 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>