167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2181 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  100 
 
 		 599 aa  1210    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  30.99 
 
 		 4013 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  35.32 
 
 		 315 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  33.49 
 
 		 1483 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  24.21 
 
 		 3602 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  48.28 
 
 		 2377 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  44.66 
 
 		 3927 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  51.09 
 
 		 1547 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  43.02 
 
 		 4896 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  45.98 
 
 		 3793 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  40 
 
 		 3471 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  29.6 
 
 		 3737 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  37.5 
 
 		 3227 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  40.38 
 
 		 1152 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  44.71 
 
 		 2402 aa  77.8  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2520 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1059 aa  75.9  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1665 aa  76.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  28.64 
 
 		 2121 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1980 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  36.44 
 
 		 2270 aa  73.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  45.35 
 
 		 581 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35.42 
 
 		 2005 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  34.07 
 
 		 2367 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  34.07 
 
 		 2421 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.11 
 
 		 2927 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  32.41 
 
 		 2296 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  34.07 
 
 		 2454 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  34.07 
 
 		 2411 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  35.45 
 
 		 1526 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  34.07 
 
 		 2807 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  41.98 
 
 		 711 aa  71.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  32.2 
 
 		 750 aa  70.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  27.75 
 
 		 2487 aa  70.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.64 
 
 		 2772 aa  70.1  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.83 
 
 		 3191 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  27.05 
 
 		 2520 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  34.26 
 
 		 822 aa  67.4  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1259 aa  67  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  42.22 
 
 		 615 aa  67  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1067 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  35.04 
 
 		 2267 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  36.78 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  39.51 
 
 		 3324 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  30 
 
 		 1857 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  37.21 
 
 		 657 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  30 
 
 		 1533 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  30 
 
 		 2113 aa  65.1  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.55 
 
 		 2490 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1066 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  26.55 
 
 		 2490 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.55 
 
 		 2358 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  26.55 
 
 		 2358 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  33.61 
 
 		 2478 aa  63.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  31.4 
 
 		 2064 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.53 
 
 		 2490 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  25.52 
 
 		 2487 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  24.83 
 
 		 5010 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.23 
 
 		 5010 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  29.77 
 
 		 751 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  32.28 
 
 		 969 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  24.87 
 
 		 2490 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  34.86 
 
 		 1389 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  33.33 
 
 		 799 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1139 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  31.68 
 
 		 2022 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  38.78 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  32.28 
 
 		 963 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.6 
 
 		 5745 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  39.29 
 
 		 1111 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  26 
 
 		 2485 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1461 aa  60.8  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  31.43 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  26.13 
 
 		 2489 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  37.11 
 
 		 968 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  29.66 
 
 		 2602 aa  60.5  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  26.15 
 
 		 5017 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  26.15 
 
 		 5017 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  34.88 
 
 		 689 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.15 
 
 		 5017 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  29.91 
 
 		 1371 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  24.78 
 
 		 1519 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  29.25 
 
 		 735 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  32.2 
 
 		 658 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.33 
 
 		 3542 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.83 
 
 		 5017 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  37.5 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  33.72 
 
 		 2588 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  32.63 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.52 
 
 		 5010 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  39.77 
 
 		 794 aa  57.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  26.53 
 
 		 2490 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  31.19 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  40.66 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  24.48 
 
 		 5017 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.46 
 
 		 1620 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  33.67 
 
 		 652 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  32.91 
 
 		 637 aa  57  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  42.31 
 
 		 852 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1287 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>