More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5368 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.51 
 
 		 1884 aa  680    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  37 
 
 		 4978 aa  1311    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.97 
 
 		 4220 aa  907    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  100 
 
 		 3927 aa  7384    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.27 
 
 		 3191 aa  659    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  54.83 
 
 		 2377 aa  2112    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  33 
 
 		 4848 aa  714    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  40.12 
 
 		 5745 aa  1472    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  42.28 
 
 		 1867 aa  572  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.92 
 
 		 4836 aa  557  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.62 
 
 		 4122 aa  493  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  25.98 
 
 		 9867 aa  476  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  40.59 
 
 		 1269 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  35.17 
 
 		 2074 aa  441  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  37.94 
 
 		 1268 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  39.32 
 
 		 1269 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  32.92 
 
 		 3474 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.83 
 
 		 3544 aa  360  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 		 3699 aa  358  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  42.88 
 
 		 1597 aa  357  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.75 
 
 		 3699 aa  355  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.04 
 
 		 3363 aa  348  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  33.28 
 
 		 4231 aa  337  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  46.51 
 
 		 4896 aa  315  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  25.65 
 
 		 16311 aa  313  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  33.71 
 
 		 2555 aa  304  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.11 
 
 		 994 aa  303  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26.89 
 
 		 5020 aa  295  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.36 
 
 		 2839 aa  288  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  41.64 
 
 		 3793 aa  265  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30.24 
 
 		 1706 aa  259  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.42 
 
 		 11716 aa  255  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  37.87 
 
 		 892 aa  253  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  29.1 
 
 		 8321 aa  251  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.54 
 
 		 2507 aa  246  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  29.43 
 
 		 2567 aa  242  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.79 
 
 		 2767 aa  241  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.55 
 
 		 1949 aa  238  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  32.36 
 
 		 4854 aa  234  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.2 
 
 		 2114 aa  233  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  30.84 
 
 		 4465 aa  229  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  42.82 
 
 		 1512 aa  225  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.62 
 
 		 850 aa  222  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  34.04 
 
 		 7284 aa  213  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.81 
 
 		 1011 aa  204  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.09 
 
 		 2812 aa  203  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  26.64 
 
 		 3439 aa  203  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1026  hypothetical protein  28.45 
 
 		 3516 aa  200  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301497 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.65 
 
 		 3477 aa  195  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  37.02 
 
 		 2816 aa  195  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.6 
 
 		 3816 aa  193  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  46.74 
 
 		 3471 aa  192  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  33.52 
 
 		 2853 aa  189  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  24.73 
 
 		 3182 aa  189  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  29.66 
 
 		 1367 aa  189  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  30.1 
 
 		 1363 aa  187  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  28.13 
 
 		 3244 aa  185  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.75 
 
 		 2153 aa  182  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.11 
 
 		 1433 aa  181  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.3 
 
 		 761 aa  180  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  24.61 
 
 		 2524 aa  178  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  28.73 
 
 		 16322 aa  174  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.26 
 
 		 1067 aa  173  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  40.06 
 
 		 721 aa  171  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.42 
 
 		 1056 aa  170  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.72 
 
 		 1779 aa  168  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  24.77 
 
 		 2784 aa  168  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  32.43 
 
 		 2820 aa  163  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.42 
 
 		 369 aa  162  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  43.46 
 
 		 1416 aa  160  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.84 
 
 		 1063 aa  159  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.75 
 
 		 2807 aa  154  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  27.71 
 
 		 2887 aa  153  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  29.85 
 
 		 1631 aa  151  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  23.48 
 
 		 3758 aa  149  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.33 
 
 		 4798 aa  149  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  32.51 
 
 		 814 aa  145  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  30.79 
 
 		 1141 aa  141  3.0000000000000003e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  32.87 
 
 		 2353 aa  139  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.21 
 
 		 2656 aa  137  5e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  31.48 
 
 		 2522 aa  136  9e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.79 
 
 		 802 aa  132  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  26.33 
 
 		 4285 aa  132  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  33.6 
 
 		 2503 aa  131  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  31.09 
 
 		 2193 aa  131  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.26 
 
 		 1599 aa  130  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.51 
 
 		 3089 aa  129  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  29.87 
 
 		 1410 aa  125  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  29.87 
 
 		 1410 aa  125  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  29.87 
 
 		 1408 aa  124  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.59 
 
 		 2812 aa  123  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.81 
 
 		 5839 aa  122  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4071  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.39 
 
 		 1109 aa  120  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.041867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.41 
 
 		 2476 aa  119  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  29.95 
 
 		 1428 aa  117  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  42.47 
 
 		 715 aa  116  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  45.93 
 
 		 315 aa  114  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  35.06 
 
 		 666 aa  113  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.19 
 
 		 5787 aa  113  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.21 
 
 		 3396 aa  110  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>