More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5274 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  55.7 
 
 		 3927 aa  2215    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  100 
 
 		 2377 aa  4633    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.74 
 
 		 5745 aa  590  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  41.56 
 
 		 1867 aa  541  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.73 
 
 		 4978 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.57 
 
 		 1884 aa  520  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  38.82 
 
 		 1269 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  37.8 
 
 		 1268 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  37.93 
 
 		 1269 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.98 
 
 		 4220 aa  379  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  39.9 
 
 		 1597 aa  346  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  30.76 
 
 		 3191 aa  316  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  31.12 
 
 		 2074 aa  311  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  29.16 
 
 		 4848 aa  303  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  30.98 
 
 		 3474 aa  270  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  28.77 
 
 		 9867 aa  270  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  64.1 
 
 		 4896 aa  268  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.98 
 
 		 994 aa  268  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.91 
 
 		 2114 aa  257  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.04 
 
 		 3363 aa  251  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  28 
 
 		 2767 aa  234  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.67 
 
 		 850 aa  229  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.15 
 
 		 1949 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  42.37 
 
 		 1512 aa  221  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.51 
 
 		 892 aa  220  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.71 
 
 		 4122 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  30.07 
 
 		 1367 aa  215  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.33 
 
 		 2507 aa  213  4e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  53.07 
 
 		 3471 aa  204  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.62 
 
 		 3477 aa  199  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 2555 aa  199  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  34.41 
 
 		 2816 aa  196  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  27.72 
 
 		 2839 aa  194  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  35.97 
 
 		 721 aa  191  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  27.17 
 
 		 2656 aa  185  9.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  29.41 
 
 		 16322 aa  172  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  28.11 
 
 		 1363 aa  169  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.65 
 
 		 1433 aa  169  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  38.86 
 
 		 3793 aa  167  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.52 
 
 		 761 aa  166  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  39.93 
 
 		 1416 aa  166  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.57 
 
 		 3816 aa  164  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.4 
 
 		 1056 aa  163  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  34.57 
 
 		 7284 aa  159  7e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  29.1 
 
 		 5094 aa  157  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.23 
 
 		 4836 aa  156  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.1 
 
 		 3699 aa  156  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.95 
 
 		 2153 aa  156  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2913  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.08 
 
 		 1067 aa  153  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511883  normal  0.352036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.88 
 
 		 3699 aa  152  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.16 
 
 		 1063 aa  150  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  26.45 
 
 		 3544 aa  149  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3331  outer membrane adhesin like proteiin  25.78 
 
 		 3439 aa  147  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  27.54 
 
 		 2853 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  27.6 
 
 		 2567 aa  143  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0510  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.18 
 
 		 2812 aa  136  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.08 
 
 		 369 aa  135  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.12 
 
 		 4798 aa  135  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  31.94 
 
 		 814 aa  134  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  28.91 
 
 		 2820 aa  133  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  27.76 
 
 		 1706 aa  132  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  31.72 
 
 		 1428 aa  131  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 1408 aa  129  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.26 
 
 		 2812 aa  129  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 1410 aa  129  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 1410 aa  129  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  24.91 
 
 		 3089 aa  126  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  28.02 
 
 		 1422 aa  124  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1009  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.14 
 
 		 802 aa  123  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  58.89 
 
 		 315 aa  122  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  36.76 
 
 		 2478 aa  119  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  26.4 
 
 		 1779 aa  118  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  27.84 
 
 		 1141 aa  118  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  42 
 
 		 1066 aa  112  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  34.6 
 
 		 666 aa  112  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  26 
 
 		 5020 aa  112  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  38.94 
 
 		 1712 aa  112  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  38.29 
 
 		 2267 aa  112  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1718  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.84 
 
 		 777 aa  112  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2430  VBCS repeat-containing protein  24.28 
 
 		 3758 aa  110  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.39 
 
 		 2807 aa  107  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.95 
 
 		 3227 aa  107  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  29.63 
 
 		 2353 aa  103  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  34.38 
 
 		 2602 aa  100  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  29.06 
 
 		 6211 aa  100  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  27.17 
 
 		 1011 aa  99.4  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  26.31 
 
 		 8321 aa  98.6  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  39.86 
 
 		 1483 aa  98.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.69 
 
 		 1750 aa  98.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  48.28 
 
 		 599 aa  97.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  40.53 
 
 		 1502 aa  95.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  35.8 
 
 		 567 aa  95.1  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1744 aa  94.7  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1806 aa  94  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  26.11 
 
 		 4285 aa  92  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  30.83 
 
 		 2345 aa  90.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  46.27 
 
 		 912 aa  91.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  26.21 
 
 		 4106 aa  90.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  25.87 
 
 		 3244 aa  90.5  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.6 
 
 		 5839 aa  90.5  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>