101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5691 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  100 
 
 		 662 aa  1362    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  38.15 
 
 		 886 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  36.27 
 
 		 650 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  29.05 
 
 		 1620 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1287 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.86 
 
 		 1602 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  29.53 
 
 		 1606 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  38.32 
 
 		 642 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  29.18 
 
 		 627 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  28.74 
 
 		 885 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 1371 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  26.76 
 
 		 540 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.47 
 
 		 1466 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1488 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  28.87 
 
 		 1222 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  27.09 
 
 		 799 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  28.1 
 
 		 636 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.48 
 
 		 4071 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1228 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  25.07 
 
 		 890 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  24 
 
 		 541 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  22.81 
 
 		 1152 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1245 aa  81.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  25.08 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  34.17 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  27.01 
 
 		 808 aa  80.5  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  30.68 
 
 		 1162 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  25.58 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  29.1 
 
 		 1230 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  24.73 
 
 		 637 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  29.18 
 
 		 2833 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  38.2 
 
 		 3542 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  31.97 
 
 		 1389 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1163 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  25.97 
 
 		 652 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  27.89 
 
 		 1140 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  24.69 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  32.32 
 
 		 677 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  28.97 
 
 		 4429 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  27.01 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  29.89 
 
 		 694 aa  73.9  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  25.42 
 
 		 534 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  23.76 
 
 		 938 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  25.55 
 
 		 794 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  26.64 
 
 		 2980 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  30.83 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  31.36 
 
 		 598 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  37.08 
 
 		 2972 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  32.17 
 
 		 822 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  24.12 
 
 		 1463 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  29.33 
 
 		 749 aa  67  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  32.39 
 
 		 3851 aa  66.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1313 aa  66.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  28.31 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  38.38 
 
 		 2064 aa  65.1  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  23.65 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  26.25 
 
 		 1987 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  29.03 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.28 
 
 		 3682 aa  61.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  27.12 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1059 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  30.43 
 
 		 640 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  23.99 
 
 		 797 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1259 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1064 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  27.2 
 
 		 2772 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  27.97 
 
 		 967 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  25 
 
 		 1111 aa  57.4  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  26.06 
 
 		 3227 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  28.28 
 
 		 496 aa  55.5  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  32.63 
 
 		 950 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  28.69 
 
 		 968 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  41.07 
 
 		 3324 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  32.18 
 
 		 429 aa  52.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.35 
 
 		 3471 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  45.59 
 
 		 874 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  43.64 
 
 		 5745 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2471  hypothetical protein  31.2 
 
 		 836 aa  51.2  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  33.33 
 
 		 6497 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 2588 aa  51.2  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  28.68 
 
 		 2262 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  25.5 
 
 		 750 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1980 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  35.21 
 
 		 969 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.71 
 
 		 1266 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  35.21 
 
 		 963 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  27.72 
 
 		 2270 aa  47.4  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  24.16 
 
 		 2807 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  24.44 
 
 		 2367 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  24.54 
 
 		 2411 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.32 
 
 		 2421 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.93 
 
 		 2454 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.76 
 
 		 2713 aa  45.4  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  25.63 
 
 		 742 aa  44.7  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  44.44 
 
 		 676 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1139 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  27.89 
 
 		 1170 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  30.63 
 
 		 972 aa  44.3  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  31.91 
 
 		 3958 aa  44.3  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  28.03 
 
 		 759 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>