182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2962 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  100 
 
 		 1287 aa  2635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  34.88 
 
 		 886 aa  205  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  34.43 
 
 		 808 aa  188  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.14 
 
 		 2833 aa  173  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  30.81 
 
 		 885 aa  158  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.99 
 
 		 4071 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  29.21 
 
 		 890 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.11 
 
 		 1606 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  28.61 
 
 		 662 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  39.53 
 
 		 642 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  27.55 
 
 		 541 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  26.36 
 
 		 3793 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  31.82 
 
 		 496 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.65 
 
 		 2270 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1488 aa  119  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  29.03 
 
 		 650 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.7 
 
 		 627 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1245 aa  112  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  28.83 
 
 		 403 aa  112  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  24.16 
 
 		 1222 aa  111  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  25.67 
 
 		 1466 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  29.66 
 
 		 400 aa  109  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1313 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.76 
 
 		 1602 aa  105  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  28.36 
 
 		 938 aa  101  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  24.07 
 
 		 1371 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  29.89 
 
 		 491 aa  100  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  29.61 
 
 		 378 aa  95.9  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  25.5 
 
 		 1620 aa  95.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  32.78 
 
 		 404 aa  94.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  29.52 
 
 		 1162 aa  94  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  28.49 
 
 		 503 aa  94  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  32.82 
 
 		 490 aa  92.4  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  23.5 
 
 		 749 aa  90.9  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  26.61 
 
 		 532 aa  91.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  33 
 
 		 401 aa  91.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  26.74 
 
 		 637 aa  89.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  24.48 
 
 		 540 aa  89  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1163 aa  88.6  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  32.48 
 
 		 1140 aa  86.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  31.11 
 
 		 2064 aa  86.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  32.8 
 
 		 799 aa  85.9  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.32 
 
 		 822 aa  85.5  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.56 
 
 		 794 aa  85.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  26.74 
 
 		 2262 aa  85.1  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  28.28 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  27.35 
 
 		 991 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  28.37 
 
 		 1230 aa  84  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.94 
 
 		 1345 aa  83.2  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.41 
 
 		 391 aa  83.6  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.71 
 
 		 2402 aa  82.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  35.94 
 
 		 636 aa  82.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  29.06 
 
 		 535 aa  81.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  24.53 
 
 		 3324 aa  81.6  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  27.91 
 
 		 648 aa  81.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  24.18 
 
 		 2411 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  23.99 
 
 		 2367 aa  79.7  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.16 
 
 		 792 aa  78.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  28.57 
 
 		 750 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  27.61 
 
 		 657 aa  78.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  23.39 
 
 		 2807 aa  78.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  25.07 
 
 		 2980 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  23.71 
 
 		 2454 aa  77  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  30.9 
 
 		 408 aa  77  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  24.04 
 
 		 2421 aa  75.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  31.58 
 
 		 3227 aa  75.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1228 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  39.13 
 
 		 694 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.13 
 
 		 1657 aa  74.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  36.84 
 
 		 652 aa  74.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4789  YD repeat protein  29.7 
 
 		 2864 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.74 
 
 		 870 aa  74.3  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.47 
 
 		 1068 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  26.26 
 
 		 1266 aa  73.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 1389 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  30.36 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  31.62 
 
 		 640 aa  73.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  25 
 
 		 1152 aa  72.8  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1547 aa  72  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  30.51 
 
 		 967 aa  72  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  27.27 
 
 		 989 aa  72  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  33.71 
 
 		 3542 aa  70.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  30.14 
 
 		 258 aa  70.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  23.52 
 
 		 815 aa  70.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  30.77 
 
 		 658 aa  69.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  21.18 
 
 		 2772 aa  68.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  35.87 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1329 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  31.08 
 
 		 629 aa  67.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  21.36 
 
 		 410 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.09 
 
 		 1288 aa  67  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3851 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  28.8 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  32.48 
 
 		 534 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  34.65 
 
 		 3682 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  28.07 
 
 		 1160 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  30.43 
 
 		 840 aa  66.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.71 
 
 		 4896 aa  65.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  26.46 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  24.87 
 
 		 4429 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>