24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6283 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  827    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  33.59 
 
 		 761 aa  93.2  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  29.61 
 
 		 801 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  30.2 
 
 		 603 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  32.32 
 
 		 812 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  30.03 
 
 		 1531 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  27.88 
 
 		 1862 aa  69.7  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1111 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  29.26 
 
 		 2554 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  25.14 
 
 		 1230 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  29.08 
 
 		 1532 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.64 
 
 		 696 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  29.74 
 
 		 3295 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  25.95 
 
 		 258 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  26.47 
 
 		 938 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  23.68 
 
 		 1152 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.3 
 
 		 917 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  25.45 
 
 		 840 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  28.63 
 
 		 501 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.67 
 
 		 940 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  23.74 
 
 		 626 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  23.17 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  22.56 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  24.39 
 
 		 491 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>