79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2780 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1348    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  85.03 
 
 		 657 aa  1143    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.97 
 
 		 4071 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.28 
 
 		 2833 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  27.53 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  26.58 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  29.26 
 
 		 742 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  36.22 
 
 		 581 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1547 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  29.48 
 
 		 490 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1287 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  42.71 
 
 		 1980 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  25.38 
 
 		 938 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  30.09 
 
 		 2270 aa  78.2  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  25.19 
 
 		 989 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.12 
 
 		 991 aa  75.1  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1934  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  43.04 
 
 		 2402 aa  71.2  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.69 
 
 		 1152 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.75 
 
 		 1483 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.23 
 
 		 2377 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0345  hypothetical protein  28.76 
 
 		 689 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 3927 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  24 
 
 		 1222 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.44 
 
 		 3471 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  36.78 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  26.9 
 
 		 750 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  27.4 
 
 		 2807 aa  65.1  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.01 
 
 		 2421 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  27.01 
 
 		 2454 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 		 3793 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 		 4896 aa  63.9  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  36.61 
 
 		 2367 aa  63.9  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  25 
 
 		 1068 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  36.61 
 
 		 2411 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1059 aa  61.6  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  23.38 
 
 		 636 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  33.02 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  38.24 
 
 		 2772 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  22.84 
 
 		 652 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1111 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1078  hypothetical protein  31.15 
 
 		 735 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0714016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.56 
 
 		 3324 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  24.12 
 
 		 1345 aa  54.3  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  31 
 
 		 815 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  34.02 
 
 		 969 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  34.02 
 
 		 963 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  26.92 
 
 		 1288 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1313 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  30.08 
 
 		 950 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  22.57 
 
 		 885 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  21.21 
 
 		 1466 aa  52.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  30.3 
 
 		 968 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.8 
 
 		 3227 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  24.9 
 
 		 890 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2517  hypothetical protein  32.61 
 
 		 615 aa  51.2  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  25.84 
 
 		 535 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  29 
 
 		 751 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  22.87 
 
 		 1657 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  22.27 
 
 		 561 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1488 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  35 
 
 		 711 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  24.42 
 
 		 532 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  23.61 
 
 		 499 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  36.36 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  23.01 
 
 		 726 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  26.13 
 
 		 1602 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  30.1 
 
 		 627 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1259 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.11 
 
 		 5745 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  31.37 
 
 		 2296 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1448  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1100 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0531  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1032 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  29.67 
 
 		 503 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  29.29 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  32.63 
 
 		 3737 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  28.14 
 
 		 2005 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  28.89 
 
 		 792 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>