294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4432 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0124  peptidase M6 immune inhibitor A  58.34 
 
 
867 aa  912    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  58.03 
 
 
935 aa  1033    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  67.03 
 
 
951 aa  1214    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0124  peptidase M6, immune inhibitor A  58.99 
 
 
856 aa  941    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000205942  unclonable  0.000000000253026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4432  peptidase M6, immune inhibitor A  100 
 
 
951 aa  1927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00957911  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0128  M6 family metalloprotease domain protein  58.36 
 
 
865 aa  918    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  64.84 
 
 
965 aa  1211    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  59.34 
 
 
945 aa  1084    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0129  M6 family metalloprotease  58.22 
 
 
871 aa  892    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4230  peptidase M6, immune inhibitor A  58.13 
 
 
871 aa  894    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.187448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  58.21 
 
 
938 aa  1056    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  58.49 
 
 
869 aa  934    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0828059  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0094  peptidase M6, immune inhibitor A  56.66 
 
 
865 aa  929    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  57.59 
 
 
936 aa  1025    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  57.92 
 
 
936 aa  1030    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  57.08 
 
 
938 aa  1011    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  37.33 
 
 
918 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  34.77 
 
 
751 aa  366  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0740  immune inhibitor A metalloprotease  32.76 
 
 
799 aa  350  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000142513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0800  immune inhibitor A metalloprotease  32.27 
 
 
799 aa  347  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000400442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0638  immune inhibitor A metalloprotease  32.15 
 
 
799 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.160109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0672  immune inhibitor a metalloprotease  32.15 
 
 
799 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000318006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0728  immune inhibitor A metalloprotease  32.15 
 
 
799 aa  341  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.74275e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0585  peptidase M6 immune inhibitor A  32.52 
 
 
796 aa  340  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4009  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.17 
 
 
795 aa  340  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000486649  decreased coverage  2.1693499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0581  immune inhibitor A, metalloprotease  32.03 
 
 
799 aa  340  9e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0582  immune inhibitor A, metalloprotease  32.03 
 
 
799 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.286356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0703  immune inhibitor A metalloprotease  31.91 
 
 
799 aa  340  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000682941  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1335  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.89 
 
 
796 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00051672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1437  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  32.47 
 
 
795 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1005  peptidase M6 immune inhibitor A  32.96 
 
 
795 aa  337  5e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4635  immune inhibitor A metalloprotease  31.66 
 
 
799 aa  337  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000450227  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3035  immune inhibitor A  33.09 
 
 
794 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000174925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1396  immune inhibitor A metalloprotease  31.85 
 
 
796 aa  336  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00116744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3037  proteinase  33.04 
 
 
794 aa  335  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000211319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3001  immune inhibitor A  33.46 
 
 
795 aa  335  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.018121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1177  immune inhibitor A  32.22 
 
 
796 aa  335  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2240  immune inhibitor A  33.33 
 
 
795 aa  333  9e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00227044  hitchhiker  0.00000656343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0880  peptidase M6 immune inhibitor A  33.04 
 
 
812 aa  333  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000627944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1197  immune inhibitor A metalloprotease  31.98 
 
 
795 aa  332  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.989973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1175  immune inhibitor A  31.7 
 
 
795 aa  332  2e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1199  peptidase M6 immune inhibitor A  31.86 
 
 
795 aa  332  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0164626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1373  immune inhibitor A metalloprotease InhA1  31.7 
 
 
795 aa  332  2e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000139862 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1295  immune inhibitor a metalloprotease  31.98 
 
 
795 aa  332  2e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00741002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3107  immune inhibitor A  32.47 
 
 
795 aa  312  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.628659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0333  M6 family metalloprotease domain protein  33.73 
 
 
763 aa  234  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.596223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0344  M6 family metalloprotease domain protein  32.78 
 
 
763 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  30.19 
 
 
770 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  30.43 
 
 
781 aa  220  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0322  peptidase M6, immune inhibitor A  31.56 
 
 
764 aa  214  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0829  peptidase M6, immune inhibitor A  31.17 
 
 
746 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.07 
 
 
744 aa  211  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  30.51 
 
 
927 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.3 
 
 
1045 aa  197  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2724  peptidase M6 immune inhibitor A  28.98 
 
 
771 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0015  peptidase M6, immune inhibitor A  30.04 
 
 
760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5286  M6 family metalloprotease domain protein  29.97 
 
 
768 aa  179  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  0.474282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4435  peptidase M6 immune inhibitor A  27.93 
 
 
806 aa  171  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431227  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  26.13 
 
 
924 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  26.78 
 
 
811 aa  147  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  27.22 
 
 
747 aa  146  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3939  peptidase M6, immune inhibitor A  25.49 
 
 
825 aa  134  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  30.03 
 
 
918 aa  99  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2374  M6 family metalloprotease domain protein  31.14 
 
 
566 aa  92.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239302  hitchhiker  0.000554149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  39.2 
 
 
910 aa  84.3  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  37.56 
 
 
1150 aa  82.4  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.51 
 
 
3295 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.23 
 
 
735 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  41.43 
 
 
792 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2144  peptidase M6, immune inhibitor A  26.76 
 
 
513 aa  79  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0726754  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  35.63 
 
 
752 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  34.69 
 
 
530 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  33.69 
 
 
528 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.95 
 
 
2554 aa  77.4  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  39.1 
 
 
1027 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.22 
 
 
685 aa  76.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  33.15 
 
 
859 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  28.04 
 
 
1667 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  36.87 
 
 
552 aa  76.3  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.94 
 
 
1916 aa  75.5  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  34.21 
 
 
963 aa  75.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  31.61 
 
 
581 aa  75.5  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.7 
 
 
1732 aa  75.5  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  40.85 
 
 
1565 aa  75.5  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  36.69 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.65 
 
 
1842 aa  75.1  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  32.98 
 
 
2122 aa  74.7  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  35.44 
 
 
675 aa  74.3  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.24 
 
 
669 aa  73.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  38.6 
 
 
1236 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  32.84 
 
 
1356 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44705  predicted protein  32.75 
 
 
735 aa  73.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35.71 
 
 
679 aa  73.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  39.55 
 
 
1095 aa  72.4  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  30.05 
 
 
861 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44694  metalloprotease  27.41 
 
 
1028 aa  72  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44695  predicted protein  32.75 
 
 
1096 aa  71.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.874089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  33.89 
 
 
615 aa  71.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  35.66 
 
 
941 aa  72  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  30.68 
 
 
1682 aa  71.2  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>