151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1645 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  100 
 
 		 2487 aa  4918    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  41.34 
 
 		 2588 aa  440  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  56.96 
 
 		 3191 aa  394  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  44.77 
 
 		 1665 aa  177  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  40.31 
 
 		 2344 aa  175  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1644  hypothetical protein  34.12 
 
 		 2602 aa  171  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0367  hypothetical protein  33.1 
 
 		 2478 aa  155  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  30.74 
 
 		 3089 aa  148  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  38.53 
 
 		 1634 aa  145  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  27.78 
 
 		 5745 aa  135  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1618  hypothetical protein  36.59 
 
 		 2267 aa  128  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.79 
 
 		 2239 aa  107  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  49.04 
 
 		 3602 aa  101  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.67 
 
 		 6885 aa  99  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  26.87 
 
 		 4978 aa  96.3  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  33.5 
 
 		 2005 aa  95.9  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0770  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  43.97 
 
 		 231 aa  90.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3021  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.27 
 
 		 337 aa  89.7  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0455  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  44.35 
 
 		 171 aa  89.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  34.5 
 
 		 907 aa  88.2  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1697  hypothetical protein  44 
 
 		 1461 aa  87.8  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  38.64 
 
 		 2262 aa  85.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  43.28 
 
 		 3634 aa  84  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  43.28 
 
 		 2078 aa  83.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1588  Outer membrane autotransporter barrel  33.22 
 
 		 1184 aa  83.2  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.98 
 
 		 2833 aa  83.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  39.86 
 
 		 4896 aa  82  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  40.32 
 
 		 3737 aa  81.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 693 aa  79  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  22.3 
 
 		 9867 aa  75.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  27.08 
 
 		 2402 aa  74.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.1 
 
 		 1657 aa  74.3  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.92 
 
 		 1288 aa  74.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  39.52 
 
 		 1243 aa  74.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  29.64 
 
 		 2064 aa  73.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  32.94 
 
 		 315 aa  73.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  30.61 
 
 		 4071 aa  72.8  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  39 
 
 		 3921 aa  72  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  38.46 
 
 		 644 aa  71.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  31.9 
 
 		 2848 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  40.87 
 
 		 2912 aa  72  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  41.9 
 
 		 676 aa  71.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  27.75 
 
 		 599 aa  70.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  26.18 
 
 		 1516 aa  70.1  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  39.33 
 
 		 815 aa  69.7  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  27.98 
 
 		 4013 aa  69.3  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  43.12 
 
 		 8918 aa  67.8  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2040  hypothetical protein  33.02 
 
 		 2022 aa  67  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0726199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  31.25 
 
 		 503 aa  65.9  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  31.63 
 
 		 3471 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  28.08 
 
 		 3927 aa  63.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  37.62 
 
 		 2377 aa  63.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  44.87 
 
 		 1139 aa  63.5  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  26.5 
 
 		 1483 aa  62.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1021 aa  62.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.34 
 
 		 1259 aa  62.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  35.9 
 
 		 3324 aa  61.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  28.09 
 
 		 1008 aa  61.6  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  24.78 
 
 		 711 aa  61.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  33.68 
 
 		 3793 aa  60.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  36.9 
 
 		 1371 aa  60.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  37.35 
 
 		 750 aa  60.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  35.8 
 
 		 3227 aa  60.1  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  26.26 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  37.8 
 
 		 1389 aa  59.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1898 aa  59.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2658  hypothetical protein  28.31 
 
 		 4689 aa  59.3  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1547 aa  58.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  34.81 
 
 		 775 aa  58.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  37.5 
 
 		 822 aa  58.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  34.34 
 
 		 2367 aa  58.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  34.34 
 
 		 2421 aa  58.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  34.34 
 
 		 2411 aa  58.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  44.3 
 
 		 525 aa  58.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  33.93 
 
 		 1989 aa  57.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  36.92 
 
 		 1441 aa  57  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  34.34 
 
 		 2454 aa  57.4  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  32.74 
 
 		 3486 aa  56.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33 
 
 		 2772 aa  56.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  33.72 
 
 		 2927 aa  56.6  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  37.97 
 
 		 2807 aa  55.8  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  36.25 
 
 		 1602 aa  55.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  37.35 
 
 		 1162 aa  55.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  31.63 
 
 		 871 aa  55.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.48 
 
 		 1620 aa  54.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  43.01 
 
 		 1946 aa  54.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  33.75 
 
 		 1059 aa  54.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  30.22 
 
 		 1002 aa  54.3  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  32.82 
 
 		 983 aa  54.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3715  PKD repeat-containing protein  38.3 
 
 		 1111 aa  52.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  26.54 
 
 		 3278 aa  52.8  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  28.71 
 
 		 540 aa  52.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.2 
 
 		 1597 aa  52.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  37 
 
 		 3920 aa  52.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  30.15 
 
 		 2670 aa  52  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  40.23 
 
 		 751 aa  52.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  35 
 
 		 799 aa  51.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1064 aa  51.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  44.9 
 
 		 637 aa  52  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  33.75 
 
 		 627 aa  51.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>