72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2225 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  865    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  33.05 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  29.68 
 
 		 456 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.2 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  29.17 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  30.71 
 
 		 513 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  28.41 
 
 		 940 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  29.43 
 
 		 696 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  29.04 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.04 
 
 		 1848 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  30.93 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  28.37 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  28.88 
 
 		 938 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  31.91 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 688 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  31.47 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1969 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  30.28 
 
 		 553 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1329 aa  97.1  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  29.1 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.23 
 
 		 1272 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  27.54 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1976 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  26.99 
 
 		 840 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  31.27 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  29.62 
 
 		 2068 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.8 
 
 		 708 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  28.15 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  27.34 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  28.96 
 
 		 1531 aa  76.3  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  26.38 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  26.16 
 
 		 3295 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  28.57 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  32.89 
 
 		 917 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  29.06 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  28.27 
 
 		 2554 aa  68.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  24.82 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  26.22 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  25.85 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  25.83 
 
 		 626 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  28.23 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  24.92 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  36.75 
 
 		 3507 aa  63.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  29.11 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0420  hypothetical protein  26.84 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  26.04 
 
 		 769 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  28.66 
 
 		 950 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  25.56 
 
 		 1131 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  26.87 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  29.77 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25.28 
 
 		 870 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  23.4 
 
 		 559 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.35 
 
 		 4433 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  27.39 
 
 		 761 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  26.67 
 
 		 629 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  26.67 
 
 		 801 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  28.27 
 
 		 812 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  28.03 
 
 		 200 aa  51.2  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2033  hypothetical protein  55.56 
 
 		 208 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  24.2 
 
 		 2286 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  24.57 
 
 		 553 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.63 
 
 		 930 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  29.34 
 
 		 1532 aa  50.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  26.07 
 
 		 1862 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  27 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  22.52 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1287 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  26.22 
 
 		 676 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  24.15 
 
 		 660 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  22.95 
 
 		 538 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3235  hypothetical protein  24.88 
 
 		 611 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  27.63 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>