105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3046 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1055    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  36.77 
 
 
626 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  32.67 
 
 
840 aa  210  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  43.97 
 
 
258 aa  196  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  30.3 
 
 
400 aa  187  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  30.12 
 
 
401 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  34.05 
 
 
1131 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  31.22 
 
 
481 aa  173  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.26 
 
 
491 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  30.84 
 
 
403 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  45.09 
 
 
200 aa  148  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  30.36 
 
 
404 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  28.89 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  28.17 
 
 
629 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  27.25 
 
 
432 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  25.89 
 
 
559 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  25.42 
 
 
553 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  30.39 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.67 
 
 
940 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25.05 
 
 
870 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  33.86 
 
 
408 aa  115  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  28.15 
 
 
472 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  27.02 
 
 
382 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  24.52 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.23 
 
 
501 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  27.51 
 
 
938 aa  94.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.53 
 
 
769 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  26.77 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  47.3 
 
 
831 aa  77  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  26.65 
 
 
708 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  49.32 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  32.67 
 
 
749 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  39.19 
 
 
1056 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  42.05 
 
 
883 aa  73.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  34.58 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  45.88 
 
 
697 aa  71.2  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  41.03 
 
 
958 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  36.36 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  25.78 
 
 
714 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  27.43 
 
 
429 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  49.21 
 
 
561 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  32.08 
 
 
668 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  39 
 
 
787 aa  69.3  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  29.34 
 
 
1862 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  29.49 
 
 
938 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  46.48 
 
 
887 aa  68.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.62 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  41.56 
 
 
698 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  37.25 
 
 
579 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  50 
 
 
884 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  50 
 
 
848 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  39.08 
 
 
735 aa  67  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  25.85 
 
 
430 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  40 
 
 
298 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  42.47 
 
 
676 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  42.5 
 
 
391 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  31.53 
 
 
479 aa  64.3  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 
522 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  37.78 
 
 
390 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.12 
 
 
930 aa  63.5  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  23.19 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  35.63 
 
 
919 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  42.67 
 
 
709 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  24.07 
 
 
917 aa  62.4  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  38.96 
 
 
869 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  25.07 
 
 
1531 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  42.47 
 
 
627 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  29.06 
 
 
488 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  41.33 
 
 
294 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 
479 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  35.42 
 
 
595 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  39.34 
 
 
472 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  33.78 
 
 
581 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  42.62 
 
 
389 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  38.46 
 
 
110 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  24.79 
 
 
688 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  33.63 
 
 
1287 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  25.41 
 
 
405 aa  57.4  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.26 
 
 
594 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  38.46 
 
 
433 aa  57  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  39.39 
 
 
739 aa  57  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  27.21 
 
 
502 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  20.61 
 
 
696 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  41.67 
 
 
522 aa  53.9  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  23.9 
 
 
477 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  23.38 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  23.61 
 
 
2068 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  25.53 
 
 
761 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  22.22 
 
 
575 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  34.88 
 
 
343 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  24.9 
 
 
603 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  27.63 
 
 
2554 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  23.9 
 
 
2286 aa  50.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  22.92 
 
 
436 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  25.21 
 
 
1848 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  25.64 
 
 
4433 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  21.78 
 
 
480 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25.81 
 
 
3507 aa  47.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  26.9 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>