47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2292 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  225  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  71.83 
 
 
676 aa  116  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  68.12 
 
 
668 aa  110  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  69.57 
 
 
387 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  62.86 
 
 
488 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  66.18 
 
 
930 aa  103  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  64.71 
 
 
749 aa  102  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  47.06 
 
 
479 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  56.79 
 
 
579 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  62.32 
 
 
581 aa  98.6  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  62.32 
 
 
735 aa  98.2  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  67.19 
 
 
522 aa  97.1  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  60.87 
 
 
627 aa  97.1  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  50 
 
 
848 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  65.62 
 
 
958 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  58.9 
 
 
403 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  61.43 
 
 
831 aa  95.5  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  48.45 
 
 
787 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  60.94 
 
 
561 aa  92  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  54.05 
 
 
919 aa  91.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  59.42 
 
 
709 aa  90.5  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  43.75 
 
 
391 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  49.43 
 
 
468 aa  88.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  45.56 
 
 
294 aa  88.6  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.79 
 
 
343 aa  88.2  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  58.82 
 
 
361 aa  87.8  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  48.53 
 
 
739 aa  86.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  54.41 
 
 
869 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  51.32 
 
 
298 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  52.86 
 
 
433 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  51.39 
 
 
697 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.73 
 
 
547 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  59.68 
 
 
1056 aa  84.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  54.1 
 
 
522 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  50 
 
 
698 aa  82.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  46.58 
 
 
389 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  47.83 
 
 
390 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  37.74 
 
 
479 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  43.04 
 
 
883 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  44.12 
 
 
884 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  35.92 
 
 
528 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  43.28 
 
 
595 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  37.8 
 
 
887 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  40.68 
 
 
472 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.34 
 
 
594 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  37.66 
 
 
1531 aa  49.7  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  26.39 
 
 
975 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>