41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1663 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  100 
 
 
575 aa  1153    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  24.17 
 
 
491 aa  96.3  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  27.35 
 
 
1131 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  23.97 
 
 
400 aa  95.5  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  25.62 
 
 
403 aa  94.7  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  25 
 
 
401 aa  92.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  25.07 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  22.15 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  30.97 
 
 
629 aa  73.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  22.75 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5802  hypothetical protein  28.78 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0396159  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4823  hypothetical protein  28.78 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3889  hypothetical protein  28.78 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  22.05 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  20.43 
 
 
626 aa  67.4  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  29.61 
 
 
258 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  22.95 
 
 
253 aa  63.9  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  27.55 
 
 
248 aa  63.9  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  27.59 
 
 
840 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  22.55 
 
 
538 aa  59.7  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  27.78 
 
 
229 aa  59.3  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.25 
 
 
769 aa  57.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  28.22 
 
 
200 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  28.19 
 
 
410 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.4 
 
 
1287 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  22.83 
 
 
408 aa  54.7  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  22.22 
 
 
528 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  28.35 
 
 
317 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  28.35 
 
 
317 aa  51.2  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  21.95 
 
 
481 aa  50.8  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  20.54 
 
 
870 aa  50.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  27.56 
 
 
317 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  26.12 
 
 
429 aa  48.5  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  27.34 
 
 
316 aa  47.8  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  23.4 
 
 
501 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6677  hypothetical protein  30.82 
 
 
222 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000431405  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  25.38 
 
 
385 aa  45.4  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  23.89 
 
 
417 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  23.55 
 
 
382 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  25.53 
 
 
714 aa  43.9  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  27.91 
 
 
334 aa  43.9  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>