79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0178 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  100 
 
 		 436 aa  871    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  45.76 
 
 		 456 aa  276  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  44.36 
 
 		 471 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  40.89 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  41.85 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  37.67 
 
 		 485 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  35.7 
 
 		 513 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  36.24 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  31.58 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.76 
 
 		 1272 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  35.26 
 
 		 3507 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  32.86 
 
 		 2068 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  34.1 
 
 		 4433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  28.01 
 
 		 491 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  31.13 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.58 
 
 		 400 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  31.35 
 
 		 688 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  31.61 
 
 		 2286 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  31.91 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.05 
 
 		 940 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  28.48 
 
 		 403 aa  94.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  25.45 
 
 		 401 aa  86.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  27.44 
 
 		 378 aa  86.3  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  31 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  27.11 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  28.03 
 
 		 870 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  26.67 
 
 		 501 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  27.51 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  23.99 
 
 		 938 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.18 
 
 		 1848 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  25.35 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.85 
 
 		 917 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  25.15 
 
 		 1131 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  25.42 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  25 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  25.06 
 
 		 2554 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1287 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.62 
 
 		 2807 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  25.39 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  24.17 
 
 		 3295 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  23.58 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  24.05 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  26.38 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1933 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.81 
 
 		 708 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1969 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  28.49 
 
 		 258 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  25.88 
 
 		 502 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  29.8 
 
 		 346 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  23.77 
 
 		 840 aa  53.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1329 aa  53.5  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0346  cell surface glycoprotein  26.51 
 
 		 812 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0984059  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  26.92 
 
 		 831 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.93 
 
 		 676 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.55 
 
 		 522 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.06 
 
 		 528 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.68 
 
 		 930 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  25.29 
 
 		 603 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  24 
 
 		 2198 aa  50.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25.34 
 
 		 627 aa  50.1  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  22.98 
 
 		 761 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  28.19 
 
 		 664 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.63 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  21.88 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  29.13 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 		 579 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.63 
 
 		 1862 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  33.08 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.84 
 
 		 668 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  27.95 
 
 		 538 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1976 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  30.08 
 
 		 200 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1750 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3235  hypothetical protein  26.62 
 
 		 611 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1608 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  23.06 
 
 		 481 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.64 
 
 		 1523 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.29 
 
 		 709 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  25.83 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>