91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1022 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  100 
 
 		 1933 aa  3847    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  64.3 
 
 		 2198 aa  457  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  62.44 
 
 		 2807 aa  457  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  58.65 
 
 		 4379 aa  384  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  49.04 
 
 		 1013 aa  273  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  45.37 
 
 		 1100 aa  244  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  41.77 
 
 		 8871 aa  243  4e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  40.32 
 
 		 3834 aa  241  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  39.74 
 
 		 1838 aa  229  4e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  41.58 
 
 		 858 aa  226  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  41.25 
 
 		 889 aa  226  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  39.6 
 
 		 2024 aa  223  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  39.01 
 
 		 2467 aa  212  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  40.86 
 
 		 1025 aa  209  4e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  39.95 
 
 		 901 aa  207  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  38.3 
 
 		 1557 aa  206  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  37.67 
 
 		 665 aa  181  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  33.58 
 
 		 864 aa  152  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  30.87 
 
 		 429 aa  125  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.39 
 
 		 1372 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.17 
 
 		 3563 aa  109  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.31 
 
 		 3977 aa  108  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  28.2 
 
 		 2461 aa  105  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1126 aa  106  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  30.89 
 
 		 429 aa  105  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  45.9 
 
 		 692 aa  105  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  50.43 
 
 		 2796 aa  103  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  31.9 
 
 		 569 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  29.97 
 
 		 4661 aa  99.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  35.37 
 
 		 4697 aa  97.1  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  48.7 
 
 		 2852 aa  96.3  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1280 aa  96.3  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  29.75 
 
 		 1991 aa  92  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.93 
 
 		 1183 aa  90.1  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.7 
 
 		 1176 aa  88.2  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1027 aa  87.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  42.02 
 
 		 751 aa  84.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  42.34 
 
 		 1587 aa  83.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.13 
 
 		 1052 aa  82.8  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  26.89 
 
 		 401 aa  80.9  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  26.33 
 
 		 549 aa  78.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1176 aa  76.3  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1136  hypothetical protein  26.2 
 
 		 433 aa  74.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.063435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.12 
 
 		 491 aa  73.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  40.37 
 
 		 685 aa  73.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1068 aa  72.8  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  26.63 
 
 		 403 aa  70.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  39.37 
 
 		 693 aa  70.5  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  39.09 
 
 		 16311 aa  67.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  39.29 
 
 		 3089 aa  67.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  26.16 
 
 		 400 aa  64.7  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  29.6 
 
 		 536 aa  64.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 995 aa  64.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  33.57 
 
 		 767 aa  63.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1087 aa  60.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1289 aa  60.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  26.67 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  21.75 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  29.37 
 
 		 2839 aa  58.9  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  24.13 
 
 		 440 aa  58.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.11 
 
 		 1590 aa  58.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  22.63 
 
 		 463 aa  57  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4007  hypothetical protein  27.73 
 
 		 426 aa  56.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00313676  normal  0.386375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.1 
 
 		 471 aa  55.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1585 aa  55.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  29.6 
 
 		 857 aa  55.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1588 aa  54.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.44 
 
 		 2286 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1394 aa  53.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  22.12 
 
 		 2068 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0937  hypothetical protein  26.2 
 
 		 356 aa  52  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  23.97 
 
 		 439 aa  52  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  23.68 
 
 		 4433 aa  50.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  31.97 
 
 		 595 aa  50.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25.65 
 
 		 3507 aa  50.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  26.58 
 
 		 391 aa  50.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 		 1284 aa  50.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  21.43 
 
 		 1656 aa  49.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.88 
 
 		 696 aa  49.7  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1627 aa  49.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  31.21 
 
 		 4761 aa  48.9  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.45 
 
 		 1454 aa  48.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  31.69 
 
 		 523 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  33.04 
 
 		 2135 aa  47.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  33.72 
 
 		 766 aa  47.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  30 
 
 		 1322 aa  48.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  30.57 
 
 		 485 aa  47  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  53.49 
 
 		 1532 aa  47  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  28.33 
 
 		 3320 aa  46.6  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  26.74 
 
 		 3925 aa  46.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  22.86 
 
 		 450 aa  46.2  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>