19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4872 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  887    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1136  hypothetical protein  39.14 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.063435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.51 
 
 		 8871 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  26.46 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  26.53 
 
 		 2807 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  27.48 
 
 		 665 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  26.65 
 
 		 2198 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  27.2 
 
 		 889 aa  60.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1100 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1933 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  24.87 
 
 		 429 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  26.84 
 
 		 901 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  25.85 
 
 		 858 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1280 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  27.53 
 
 		 3563 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  26.35 
 
 		 2467 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.63 
 
 		 1176 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  31.28 
 
 		 864 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1068 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>