36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0444 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  100 
 
 		 1394 aa  2812    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1647  hypothetical protein  34.49 
 
 		 639 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.201062  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2920  leucine-rich repeat-containing protein  38.1 
 
 		 763 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.660526  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1575 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  30.9 
 
 		 846 aa  102  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  30.99 
 
 		 1118 aa  101  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1270 aa  75.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1100 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.14 
 
 		 8871 aa  63.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  22.29 
 
 		 889 aa  62.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  24.44 
 
 		 2198 aa  57  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24 
 
 		 1068 aa  55.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.87 
 
 		 2003 aa  55.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  26.38 
 
 		 665 aa  54.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1933 aa  53.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1024 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  25.6 
 
 		 627 aa  51.6  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1414 aa  50.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  25.37 
 
 		 549 aa  50.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  34.67 
 
 		 1337 aa  50.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  32.94 
 
 		 550 aa  49.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  25.1 
 
 		 2807 aa  49.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  25.59 
 
 		 569 aa  48.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  22.17 
 
 		 831 aa  48.5  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.1 
 
 		 668 aa  48.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  21.79 
 
 		 429 aa  47.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4007  hypothetical protein  31.58 
 
 		 426 aa  47.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00313676  normal  0.386375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  24.58 
 
 		 346 aa  47.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  24.23 
 
 		 2467 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  31.58 
 
 		 465 aa  47  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  32.86 
 
 		 392 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  22.38 
 
 		 858 aa  46.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  32.5 
 
 		 1348 aa  46.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0427  mannosidase-related protein  44.26 
 
 		 2443 aa  46.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.37928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.58 
 
 		 588 aa  45.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  24.07 
 
 		 864 aa  45.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>