21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1784 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1784  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1126    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.135796  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0970  hypothetical protein  29.79 
 
 
983 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.351823  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3284  hypothetical protein  24.95 
 
 
524 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.323692  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3555  hypothetical protein  30 
 
 
616 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507708  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  29.77 
 
 
690 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0747  hypothetical protein  28.7 
 
 
1241 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0433  hypothetical protein  27.41 
 
 
568 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.701978  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0421  cadherin  29.52 
 
 
1323 aa  57  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.859378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3273  hypothetical protein  28.5 
 
 
587 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000120347  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09243  hypothetical protein  33.8 
 
 
1031 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.100624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  32.94 
 
 
1394 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  31.51 
 
 
371 aa  47.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  29.33 
 
 
1337 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3274  hypothetical protein  22.7 
 
 
587 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 
1433 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  26.67 
 
 
571 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  29.25 
 
 
755 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  26.67 
 
 
324 aa  43.9  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0098  Cna B domain-containing protein  39.06 
 
 
138 aa  43.5  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.685071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1022  licheninase  37.84 
 
 
465 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1877  hypothetical protein  27.52 
 
 
607 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215725  normal  0.0422068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>