45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2420 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 429 aa  848    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  34.04 
 
 		 858 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.47 
 
 		 2807 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  32.35 
 
 		 901 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  31.59 
 
 		 2198 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1933 aa  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  31.89 
 
 		 889 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.79 
 
 		 2467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  31.02 
 
 		 864 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1100 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.57 
 
 		 8871 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  37.56 
 
 		 665 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  28.48 
 
 		 569 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  30.66 
 
 		 3563 aa  76.6  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1027 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.32 
 
 		 1183 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  26.8 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1280 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25.25 
 
 		 3507 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  23.64 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1068 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1136  hypothetical protein  23.21 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.063435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  24.62 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  29.57 
 
 		 549 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  25.63 
 
 		 2068 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  22.81 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  24.42 
 
 		 471 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  25 
 
 		 1991 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  23.77 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  26.67 
 
 		 2286 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  25.62 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  22.68 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0937  hypothetical protein  31.19 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  23 
 
 		 450 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  24.7 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  22.16 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  23.66 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  24.79 
 
 		 1176 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  25.27 
 
 		 491 aa  47.4  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1394 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  24.55 
 
 		 857 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  25.09 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  30 
 
 		 1585 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  25.88 
 
 		 4433 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  24.3 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>