154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2818 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  790    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  46.55 
 
 		 930 aa  255  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  44.41 
 
 		 346 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  43.1 
 
 		 831 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  45.13 
 
 		 668 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  42.81 
 
 		 676 aa  240  4e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  38.94 
 
 		 627 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  43.48 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  37.88 
 
 		 579 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  38.54 
 
 		 752 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  41.2 
 
 		 709 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  41.34 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  38.06 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  40.89 
 
 		 522 aa  205  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  42.25 
 
 		 588 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  35.97 
 
 		 1293 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  34.47 
 
 		 930 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  34.39 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  32.04 
 
 		 491 aa  168  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.97 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1068 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  31.83 
 
 		 1079 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.38 
 
 		 786 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  32.86 
 
 		 646 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1146 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  30.56 
 
 		 1140 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  34.67 
 
 		 1163 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  30.43 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.23 
 
 		 2296 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  34.13 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1051 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.44 
 
 		 1130 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1026 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  29.8 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  26.73 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.3 
 
 		 326 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  31.71 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1030 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  29.67 
 
 		 963 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.04 
 
 		 355 aa  99.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  35.67 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 		 850 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.7 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  30 
 
 		 1177 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 		 347 aa  97.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  31.54 
 
 		 315 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.99 
 
 		 354 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.65 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  25.57 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.51 
 
 		 343 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.52 
 
 		 328 aa  93.6  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.99 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.48 
 
 		 1750 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.09 
 
 		 1292 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30.68 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.49 
 
 		 903 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28.32 
 
 		 700 aa  90.9  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  25 
 
 		 1351 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.58 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  29.18 
 
 		 361 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  25.25 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  23.1 
 
 		 892 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.67 
 
 		 693 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.1 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1230 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  23.55 
 
 		 841 aa  83.2  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.73 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  29.09 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.46 
 
 		 898 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1834 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  27.05 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  28.94 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  25.77 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25.12 
 
 		 639 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 		 772 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  30.43 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1030 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  28.24 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 888 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  26.46 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  25.48 
 
 		 913 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  22.8 
 
 		 863 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  28.44 
 
 		 899 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  26.54 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  31.71 
 
 		 684 aa  69.3  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1763 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  29.11 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  25.45 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  25.37 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  28.75 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  26.6 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1539  NHL repeat containing protein  37.66 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  26.9 
 
 		 211 aa  67  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0989  NHL repeat-containing protein  24.78 
 
 		 630 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  27.24 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  24.29 
 
 		 678 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>