18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6418 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1060    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  26.56 
 
 		 889 aa  94  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.7 
 
 		 2807 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  28.06 
 
 		 901 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  25.49 
 
 		 8871 aa  86.7  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  28.21 
 
 		 858 aa  84.7  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1933 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1100 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  26.57 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  27.47 
 
 		 2198 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  27.31 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  26.37 
 
 		 2467 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  29.15 
 
 		 429 aa  57  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1394 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  36.03 
 
 		 665 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  26.61 
 
 		 864 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  29.13 
 
 		 3563 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1068 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>