26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2590 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  865    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.42 
 
 		 2807 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1136  hypothetical protein  28.35 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.063435 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1933 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  28.43 
 
 		 901 aa  97.8  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  27.68 
 
 		 864 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  32.03 
 
 		 665 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  27.01 
 
 		 2198 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.01 
 
 		 2467 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  29.85 
 
 		 889 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  27.99 
 
 		 858 aa  77.8  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0937  hypothetical protein  23.53 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  28.06 
 
 		 3563 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.25 
 
 		 8871 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  31.88 
 
 		 569 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4872  hypothetical protein  26.46 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1100 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  29.29 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.73 
 
 		 1183 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1280 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6418  hypothetical protein  27.31 
 
 		 549 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1027 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1068 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  25.64 
 
 		 857 aa  50.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  26.18 
 
 		 1991 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.52 
 
 		 1176 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>