180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0312 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  100 
 
 
3563 aa  7001    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.69 
 
 
1183 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  33.15 
 
 
1280 aa  352  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.54 
 
 
408 aa  341  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.34 
 
 
540 aa  336  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  51.59 
 
 
920 aa  334  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  51.2 
 
 
1255 aa  323  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  49.41 
 
 
721 aa  311  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.24 
 
 
826 aa  293  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  47.48 
 
 
640 aa  290  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.19 
 
 
810 aa  290  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  30.92 
 
 
1991 aa  288  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.8 
 
 
805 aa  286  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  45.88 
 
 
1026 aa  283  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.38 
 
 
3544 aa  281  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.48 
 
 
1126 aa  281  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.75 
 
 
633 aa  281  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  43.93 
 
 
1178 aa  280  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.41 
 
 
714 aa  280  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  47.09 
 
 
2802 aa  273  5e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.4 
 
 
664 aa  264  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.71 
 
 
1607 aa  263  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  42.16 
 
 
701 aa  256  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  43.68 
 
 
1195 aa  253  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.51 
 
 
1221 aa  252  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  42.94 
 
 
1848 aa  251  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  44.71 
 
 
884 aa  249  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.02 
 
 
1507 aa  248  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.55 
 
 
1130 aa  244  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.24 
 
 
1383 aa  243  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  42.35 
 
 
1292 aa  243  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.56 
 
 
887 aa  243  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  30.71 
 
 
1027 aa  242  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.06 
 
 
2402 aa  230  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  26.94 
 
 
3699 aa  226  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  39.1 
 
 
1176 aa  225  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.72 
 
 
3699 aa  222  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  41.24 
 
 
862 aa  217  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  27.23 
 
 
857 aa  209  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  39.17 
 
 
791 aa  207  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.22 
 
 
1176 aa  202  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  38.82 
 
 
462 aa  202  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  41.28 
 
 
1285 aa  196  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  39.54 
 
 
933 aa  181  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  29.59 
 
 
2079 aa  178  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  30.4 
 
 
1585 aa  176  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  28.8 
 
 
3244 aa  170  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  37.98 
 
 
648 aa  167  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  27.78 
 
 
1588 aa  163  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  31.51 
 
 
683 aa  160  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  40.16 
 
 
288 aa  160  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  34.73 
 
 
858 aa  154  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  43.33 
 
 
1083 aa  152  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  27.88 
 
 
4465 aa  152  9e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.98 
 
 
11716 aa  152  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.44 
 
 
1673 aa  151  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  30.92 
 
 
1672 aa  150  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  26.02 
 
 
4231 aa  149  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.9 
 
 
2522 aa  142  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  26.28 
 
 
2853 aa  141  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  28.63 
 
 
1100 aa  140  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  33.71 
 
 
889 aa  139  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  34.57 
 
 
901 aa  137  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  29.09 
 
 
8871 aa  135  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  27.21 
 
 
2820 aa  133  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.23 
 
 
2807 aa  131  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  38.02 
 
 
14944 aa  130  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  30.73 
 
 
864 aa  120  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 
2198 aa  117  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  31.97 
 
 
1232 aa  116  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.23 
 
 
3542 aa  115  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  26.58 
 
 
1779 aa  111  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  29.86 
 
 
1879 aa  110  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  31.59 
 
 
665 aa  108  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.11 
 
 
3598 aa  105  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  31.17 
 
 
1933 aa  103  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  30.5 
 
 
2467 aa  101  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  30.28 
 
 
523 aa  94.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  34.38 
 
 
1969 aa  94  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  25.83 
 
 
3474 aa  90.5  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  36.21 
 
 
3911 aa  89.4  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  26.29 
 
 
2636 aa  85.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  42.71 
 
 
1550 aa  84.7  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.14 
 
 
692 aa  78.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  28.55 
 
 
1222 aa  77.4  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  36.44 
 
 
646 aa  76.3  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  29.55 
 
 
1976 aa  75.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  28.06 
 
 
429 aa  75.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  27.5 
 
 
731 aa  74.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.45 
 
 
1523 aa  74.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.74 
 
 
1362 aa  72.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  37.78 
 
 
1869 aa  72.8  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4557  putative Ig  37.9 
 
 
926 aa  70.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0762461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  29.3 
 
 
429 aa  70.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  33.51 
 
 
943 aa  70.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.12 
 
 
1454 aa  68.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  42.35 
 
 
1132 aa  68.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  25.56 
 
 
1170 aa  67.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  31.84 
 
 
1100 aa  67.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.47 
 
 
1068 aa  65.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>