21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4557 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4557  putative Ig  100 
 
 
926 aa  1794    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0762461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  41.5 
 
 
646 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  37.92 
 
 
3563 aa  80.5  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.46 
 
 
2402 aa  72.8  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  36.15 
 
 
1672 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3372  Ig family protein  38.98 
 
 
495 aa  61.6  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.477057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  33.75 
 
 
1232 aa  57.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  34.24 
 
 
1879 aa  55.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.56 
 
 
887 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.11 
 
 
692 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  34.29 
 
 
3542 aa  51.6  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.53 
 
 
1673 aa  50.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  36.61 
 
 
1222 aa  50.8  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  44.44 
 
 
935 aa  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  32.39 
 
 
1544 aa  48.5  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.67 
 
 
3911 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  40.2 
 
 
1869 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  33.19 
 
 
2079 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  37.11 
 
 
2802 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.12 
 
 
3598 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  26.14 
 
 
731 aa  45.8  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>