278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0166 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  38.41 
 
 		 2715 aa  820    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  76.7 
 
 		 2522 aa  2349    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  35.64 
 
 		 2839 aa  1013    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  39.78 
 
 		 2153 aa  719    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  88.81 
 
 		 2503 aa  2537    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  43.61 
 
 		 4231 aa  952    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  42.44 
 
 		 4465 aa  931    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  56.27 
 
 		 1911 aa  1279    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  52.09 
 
 		 3089 aa  1353    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 3699 aa  7232    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  71.81 
 
 		 2042 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  95.62 
 
 		 3699 aa  6837    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.55 
 
 		 11716 aa  741    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  78.17 
 
 		 3544 aa  3756    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  80.85 
 
 		 2476 aa  2114    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.26 
 
 		 3816 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  42.96 
 
 		 2820 aa  630  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  35.13 
 
 		 3474 aa  543  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  43.89 
 
 		 2853 aa  506  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  34.72 
 
 		 3244 aa  505  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  67.56 
 
 		 2192 aa  478  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  34.93 
 
 		 2079 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  36.24 
 
 		 2670 aa  452  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  34.03 
 
 		 1779 aa  427  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  33.79 
 
 		 3477 aa  400  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1879 aa  386  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  37.25 
 
 		 1480 aa  318  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  28.19 
 
 		 2402 aa  316  5.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  36.38 
 
 		 3598 aa  299  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  31.77 
 
 		 3191 aa  294  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1102  ATPase  34.95 
 
 		 2848 aa  283  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  32.07 
 
 		 8321 aa  281  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  34.01 
 
 		 3927 aa  281  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  46.5 
 
 		 2233 aa  276  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  34.3 
 
 		 1362 aa  256  7e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  45.08 
 
 		 2001 aa  236  8.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  26.72 
 
 		 3563 aa  222  8.999999999999998e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  29.69 
 
 		 2074 aa  218  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  28.41 
 
 		 2454 aa  213  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  28.61 
 
 		 5745 aa  213  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.81 
 
 		 1884 aa  212  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.48 
 
 		 4848 aa  209  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.66 
 
 		 4978 aa  206  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  27.13 
 
 		 5020 aa  199  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  50.22 
 
 		 2927 aa  184  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  32.25 
 
 		 1672 aa  179  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  29.15 
 
 		 3278 aa  175  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.3 
 
 		 16311 aa  173  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.57 
 
 		 1673 aa  173  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.42 
 
 		 994 aa  173  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0676  VCBS  23.31 
 
 		 4661 aa  167  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000119465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  30.22 
 
 		 5094 aa  165  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0163  hypothetical protein  83.75 
 
 		 135 aa  156  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0168  hypothetical protein  82.5 
 
 		 135 aa  155  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  23.74 
 
 		 2193 aa  154  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  37.55 
 
 		 2042 aa  154  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.09 
 
 		 850 aa  154  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  26.03 
 
 		 4285 aa  149  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  27 
 
 		 4854 aa  148  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.8 
 
 		 2507 aa  146  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  46.88 
 
 		 731 aa  142  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  28.59 
 
 		 1269 aa  137  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  31.78 
 
 		 1631 aa  134  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  27 
 
 		 1268 aa  133  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0369  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.27 
 
 		 2067 aa  132  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.936845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  31.5 
 
 		 1597 aa  131  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  28.82 
 
 		 1269 aa  129  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.65 
 
 		 761 aa  119  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  40.58 
 
 		 2132 aa  119  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  24.65 
 
 		 6678 aa  118  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  31.32 
 
 		 7284 aa  117  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.85 
 
 		 8871 aa  117  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  38.81 
 
 		 2701 aa  116  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2382  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1002 aa  114  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.647159  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  30.81 
 
 		 2816 aa  109  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.79 
 
 		 2656 aa  108  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  31.37 
 
 		 1232 aa  107  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.45 
 
 		 5787 aa  106  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  26.65 
 
 		 1867 aa  105  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  36.96 
 
 		 1367 aa  105  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  36.76 
 
 		 1363 aa  105  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.29 
 
 		 3066 aa  104  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  38.71 
 
 		 814 aa  102  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  29.34 
 
 		 1222 aa  101  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  32.29 
 
 		 1728 aa  101  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 892 aa  100  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  33.77 
 
 		 721 aa  100  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  33.05 
 
 		 2337 aa  98.2  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.4 
 
 		 4220 aa  96.3  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  38.25 
 
 		 1502 aa  94.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  28.05 
 
 		 9585 aa  95.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.54 
 
 		 2555 aa  93.6  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.67 
 
 		 887 aa  91.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  29.98 
 
 		 683 aa  90.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  47.2 
 
 		 475 aa  90.1  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.41 
 
 		 2114 aa  88.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  43.61 
 
 		 2207 aa  88.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 1422 aa  87.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1061 aa  86.7  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  45.16 
 
 		 4022 aa  85.9  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>