152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1393 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
810 aa  1635    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  83.95 
 
 
1126 aa  533  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  50.76 
 
 
707 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  48.94 
 
 
475 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  48.52 
 
 
476 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.89 
 
 
540 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  46.72 
 
 
804 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  47.16 
 
 
471 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  46.93 
 
 
471 aa  422  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  47.06 
 
 
703 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  47.68 
 
 
789 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  63.08 
 
 
633 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  63.69 
 
 
714 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  44.19 
 
 
1121 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  43.85 
 
 
1121 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  62.36 
 
 
826 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  43.69 
 
 
1121 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  58.49 
 
 
408 aa  402  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  42.12 
 
 
1112 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  60.4 
 
 
1178 aa  397  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  44.47 
 
 
488 aa  395  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  63.13 
 
 
701 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  57.03 
 
 
1026 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.44 
 
 
1221 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  56.27 
 
 
721 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  56.44 
 
 
920 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.67 
 
 
805 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  38.84 
 
 
1143 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  54.99 
 
 
1255 aa  361  3e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  55.33 
 
 
884 aa  360  8e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  42.05 
 
 
494 aa  353  8e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  39.57 
 
 
848 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  54.3 
 
 
1195 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  54.42 
 
 
640 aa  348  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  54.98 
 
 
2802 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  53.61 
 
 
1848 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55 
 
 
1607 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.97 
 
 
1130 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.44 
 
 
1383 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49 
 
 
1183 aa  327  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.73 
 
 
1507 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  37.13 
 
 
1174 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.87 
 
 
887 aa  315  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  47.51 
 
 
1292 aa  309  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  51.01 
 
 
862 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  46.5 
 
 
1176 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  49.84 
 
 
462 aa  292  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  58.24 
 
 
1285 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  51.15 
 
 
933 aa  290  1e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  45.95 
 
 
664 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  41.45 
 
 
791 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.28 
 
 
1176 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  48.19 
 
 
3563 aa  275  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  47.13 
 
 
648 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 
472 aa  211  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  42.37 
 
 
288 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  29.8 
 
 
531 aa  179  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  30.57 
 
 
581 aa  151  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  45.83 
 
 
1083 aa  151  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  28.69 
 
 
456 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.85 
 
 
356 aa  98.6  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.59 
 
 
357 aa  97.8  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.23 
 
 
355 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  29.23 
 
 
331 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  26.68 
 
 
355 aa  95.1  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.45 
 
 
352 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  31.8 
 
 
315 aa  92.4  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.54 
 
 
341 aa  89.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  31.69 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  27.25 
 
 
357 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  29.47 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.99 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.48 
 
 
343 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  26.61 
 
 
341 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.78 
 
 
346 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  28.8 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  28.92 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.47 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  28.13 
 
 
537 aa  77  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.84 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  30.51 
 
 
386 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  27.34 
 
 
334 aa  67  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  37.89 
 
 
14944 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 
503 aa  64.3  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  26.75 
 
 
829 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  46.25 
 
 
2003 aa  62.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
345 aa  61.6  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  27.57 
 
 
369 aa  60.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  23.72 
 
 
505 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  24.16 
 
 
487 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  35.77 
 
 
1550 aa  60.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.24 
 
 
1362 aa  58.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  31.54 
 
 
480 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.72 
 
 
501 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.63 
 
 
379 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.27 
 
 
699 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  24.67 
 
 
497 aa  55.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27.59 
 
 
1969 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  24.07 
 
 
334 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 
512 aa  54.3  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>