48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2946 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  100 
 
 		 683 aa  1199    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  30.57 
 
 		 4231 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  31.51 
 
 		 3563 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  31.75 
 
 		 3544 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  37.38 
 
 		 1672 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  32.54 
 
 		 2402 aa  140  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.03 
 
 		 1673 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  34.23 
 
 		 2853 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  32.88 
 
 		 887 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  34.04 
 
 		 2820 aa  124  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.52 
 
 		 4465 aa  123  9e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  28.93 
 
 		 1779 aa  104  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  34.26 
 
 		 1222 aa  101  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28 
 
 		 11716 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  31.95 
 
 		 1232 aa  100  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1879 aa  93.6  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  31.43 
 
 		 2079 aa  93.6  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  30.13 
 
 		 3244 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  36.74 
 
 		 2001 aa  91.3  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.17 
 
 		 3699 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  29.22 
 
 		 3699 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.15 
 
 		 3542 aa  80.9  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  36.23 
 
 		 731 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  49.02 
 
 		 1619 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.71 
 
 		 2522 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.61 
 
 		 3911 aa  69.7  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  25.28 
 
 		 979 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3525  Ig family protein  37.5 
 
 		 638 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.464381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.99 
 
 		 1292 aa  61.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  29.08 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  40.95 
 
 		 857 aa  60.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  23.42 
 
 		 5745 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  29.38 
 
 		 1544 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  27.98 
 
 		 1631 aa  55.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.16 
 
 		 1183 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.03 
 
 		 1394 aa  53.5  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  32.34 
 
 		 2506 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 692 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.44 
 
 		 3474 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  23.94 
 
 		 5442 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.77 
 
 		 1272 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.49 
 
 		 3598 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  29.06 
 
 		 2636 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  33.64 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  26.61 
 
 		 2193 aa  47.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  26.84 
 
 		 962 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  26.35 
 
 		 5899 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  25.79 
 
 		 4848 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>