50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0992 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  100 
 
 
979 aa  1913    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0991  hypothetical protein  46.45 
 
 
760 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  41.76 
 
 
532 aa  191  5.999999999999999e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.47 
 
 
1969 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  38.5 
 
 
1100 aa  91.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  38.29 
 
 
14944 aa  90.9  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.42 
 
 
1607 aa  89.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  35.86 
 
 
1127 aa  79.7  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  25.5 
 
 
683 aa  78.2  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  34.48 
 
 
1098 aa  75.5  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2545  hypothetical protein  26.46 
 
 
4120 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.82 
 
 
1507 aa  73.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.43 
 
 
1292 aa  71.2  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  30.66 
 
 
3563 aa  64.7  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  35.03 
 
 
737 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  25.67 
 
 
2418 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28.68 
 
 
1976 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.33 
 
 
540 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  24.02 
 
 
775 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  29.82 
 
 
2262 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  26.14 
 
 
2411 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  30.92 
 
 
332 aa  58.9  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.16 
 
 
1130 aa  58.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  26.14 
 
 
2367 aa  58.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  27.33 
 
 
2454 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1920  hypothetical protein  34.12 
 
 
3834 aa  56.6  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  27.33 
 
 
2421 aa  55.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  45.74 
 
 
1105 aa  55.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  31.02 
 
 
332 aa  55.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.9 
 
 
972 aa  54.7  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  36.15 
 
 
994 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.55 
 
 
4896 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  23 
 
 
3333 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  26.61 
 
 
976 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  34.41 
 
 
887 aa  50.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  36.36 
 
 
1550 aa  50.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  27.85 
 
 
3619 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  33.71 
 
 
1132 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.79 
 
 
1079 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 
721 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  24.86 
 
 
1755 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  27.27 
 
 
1332 aa  48.5  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.71 
 
 
735 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3101  hypothetical protein  30.36 
 
 
582 aa  46.2  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169932  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  24.67 
 
 
2807 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  27.18 
 
 
3619 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.14 
 
 
1183 aa  45.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  29.09 
 
 
4978 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  44.83 
 
 
800 aa  44.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.89 
 
 
810 aa  44.3  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>