17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3525 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3525  Ig family protein  100 
 
 		 638 aa  1217    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.464381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1961  hypothetical protein  33.99 
 
 		 940 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3714  hypothetical protein  31.85 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000011757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  37.56 
 
 		 683 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  42.34 
 
 		 1619 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  39.22 
 
 		 1869 aa  48.5  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  31.66 
 
 		 5094 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.98 
 
 		 11716 aa  47.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  27.44 
 
 		 956 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.34 
 
 		 3544 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  38.37 
 
 		 1292 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  34.04 
 
 		 2402 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2199  type IV pilus secretin PilQ  26.92 
 
 		 719 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  39.29 
 
 		 2820 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  44.44 
 
 		 731 aa  44.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  34.13 
 
 		 4465 aa  43.9  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  37.21 
 
 		 2853 aa  43.9  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>