39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4576 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  51.32 
 
 		 783 aa  770    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  100 
 
 		 956 aa  1923    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  44.17 
 
 		 1426 aa  183  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  27.27 
 
 		 599 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  24.92 
 
 		 604 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  36.22 
 
 		 296 aa  108  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  34.83 
 
 		 282 aa  95.5  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  35.14 
 
 		 268 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  35.68 
 
 		 508 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.75 
 
 		 1107 aa  75.1  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  31.64 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 589 aa  74.3  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  30.58 
 
 		 601 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 504 aa  70.1  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  35.14 
 
 		 611 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  32.34 
 
 		 787 aa  69.3  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  31.5 
 
 		 554 aa  67.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  28.99 
 
 		 772 aa  66.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  29.82 
 
 		 272 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  37.98 
 
 		 150 aa  62  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4328  hypothetical protein  26.91 
 
 		 491 aa  61.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  30.51 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  32.92 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  31.07 
 
 		 5899 aa  61.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  34.51 
 
 		 545 aa  60.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  34.19 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  25.32 
 
 		 743 aa  56.6  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  24.73 
 
 		 325 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  30.34 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  30.34 
 
 		 720 aa  53.9  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  30.52 
 
 		 380 aa  52.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  28.09 
 
 		 757 aa  52.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  34.13 
 
 		 7679 aa  52  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  34.13 
 
 		 7919 aa  52  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 480 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  33.33 
 
 		 715 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3525  Ig family protein  27.44 
 
 		 638 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.464381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0601  hypothetical protein  31.25 
 
 		 605 aa  45.8  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.214071  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  29.24 
 
 		 477 aa  45.8  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>