18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05133 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001259  hypothetical protein  94.21 
 
 		 477 aa  719    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  769    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  36.92 
 
 		 480 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03098  putative orphan protein  35.98 
 
 		 591 aa  93.2  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3267  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1123 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  30.43 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1185  Uracil-DNA glycosylase  30.92 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.233821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4622  hypothetical protein  32.74 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.417022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  41.67 
 
 		 601 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  34.78 
 
 		 783 aa  53.9  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  26.36 
 
 		 746 aa  53.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2076  protein of unknown function DUF1566  35.96 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000300588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0717  hypothetical protein  40.48 
 
 		 588 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0451  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1152 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  34.75 
 
 		 296 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  29.22 
 
 		 956 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  48.98 
 
 		 554 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  40.32 
 
 		 757 aa  43.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>