30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2065 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  68.4 
 
 		 268 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  40.69 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  38.1 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  38.38 
 
 		 395 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  30.25 
 
 		 604 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  27.92 
 
 		 1107 aa  66.2  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  28.79 
 
 		 956 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  29.41 
 
 		 599 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  35.58 
 
 		 787 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  29.47 
 
 		 773 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  29.91 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  30.37 
 
 		 772 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  27.31 
 
 		 783 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  27.59 
 
 		 1426 aa  57  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00499  acid phosphatase  28.31 
 
 		 773 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  26.62 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  26.22 
 
 		 504 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  30.97 
 
 		 508 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  40 
 
 		 380 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.86 
 
 		 3427 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1421  hypothetical protein  41.89 
 
 		 575 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000284545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  27.62 
 
 		 743 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  41.94 
 
 		 709 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  30.12 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1538 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  30.11 
 
 		 435 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  25.66 
 
 		 475 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  28.78 
 
 		 589 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>