36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3374 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3374  hypothetical protein  100 
 
 		 787 aa  1562    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.592026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  38.24 
 
 		 783 aa  91.7  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  32.34 
 
 		 956 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  35.9 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  42.11 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  48.18 
 
 		 282 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1583  cytochrome c, class I  35.76 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000740916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  35.83 
 
 		 395 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  35.86 
 
 		 709 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  34.03 
 
 		 1426 aa  70.5  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  35.71 
 
 		 272 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  39.17 
 
 		 1107 aa  67.4  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2335  hypothetical protein  38.46 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755849 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4620  hypothetical protein  26.65 
 
 		 545 aa  64.7  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  34.1 
 
 		 743 aa  63.9  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1174  putative acid phosphatase protein  37.98 
 
 		 715 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  decreased coverage  0.0088177 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4205  acid phosphatase  35.48 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.120661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4315  acid phosphatase  35.48 
 
 		 720 aa  61.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.480348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  35.84 
 
 		 757 aa  59.3  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00818  hypothetical protein  36.17 
 
 		 150 aa  55.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  29.61 
 
 		 772 aa  54.3  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4328  hypothetical protein  25.7 
 
 		 491 aa  53.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05133  hypothetical protein  47.89 
 
 		 380 aa  52.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  32.61 
 
 		 508 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  28.66 
 
 		 604 aa  50.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.3 
 
 		 3427 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  29.2 
 
 		 611 aa  47.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0345  hypothetical protein  31.07 
 
 		 724 aa  47.8  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0072  putative lipoprotein  31.87 
 
 		 480 aa  46.6  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  29.21 
 
 		 773 aa  45.8  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  28.38 
 
 		 703 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0106  hypothetical protein  29 
 
 		 596 aa  45.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3624  hypothetical protein  32.97 
 
 		 601 aa  44.7  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2707  putative lipoprotein  29.11 
 
 		 504 aa  44.3  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  36.04 
 
 		 7919 aa  44.3  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>