21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3305 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2724  hypothetical protein  61.27 
 
 		 599 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0271436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3305  hypothetical protein  100 
 
 		 604 aa  1219    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.153336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  28.73 
 
 		 783 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4576  hypothetical protein  24.96 
 
 		 956 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000693966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  36 
 
 		 1426 aa  106  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  27.56 
 
 		 296 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  32.94 
 
 		 282 aa  91.7  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2157  hypothetical protein  36.17 
 
 		 268 aa  91.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  30.94 
 
 		 395 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  31.14 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0410  peptidase domain-containing protein  28.1 
 
 		 772 aa  74.3  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0975443  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  31.18 
 
 		 1107 aa  65.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  33.9 
 
 		 611 aa  53.9  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  48.08 
 
 		 1531 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  25.56 
 
 		 773 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 575 aa  50.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000284545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  25.43 
 
 		 325 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3581  hypothetical protein  29.93 
 
 		 757 aa  47.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.09299  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1398  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 508 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.84341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3642  peptidase domain-containing protein  24.67 
 
 		 743 aa  45.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  27 
 
 		 709 aa  43.9  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>