12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001969 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00499  acid phosphatase  67.96 
 
 		 773 aa  1030    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  100 
 
 		 773 aa  1592    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  26.1 
 
 		 703 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  32.16 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  32.65 
 
 		 269 aa  55.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  30.38 
 
 		 435 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2065  hypothetical protein  28.74 
 
 		 272 aa  52  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000225207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  30.61 
 
 		 573 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4809  putative acid phosphatase protein  34.67 
 
 		 709 aa  48.1  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.73 
 
 		 1426 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3452  hypothetical protein  28.05 
 
 		 282 aa  45.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0272  hypothetical protein  27.35 
 
 		 783 aa  44.3  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.654602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>